More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02511 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02511  ParB family protein  100 
 
 		 298 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2907  ParB family protein  99.66 
 
 		 298 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02475  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2889  nuclease  87.16 
 
 		 298 aa  530  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.232082  normal  0.662657 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0771  ParB family protein  42.96 
 
 		 296 aa  239  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0033  ParB family protein  39.93 
 
 		 301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0527  ParB family protein  36.36 
 
 		 299 aa  192  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0831  parB-like partition protein  39.15 
 
 		 288 aa  188  8e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1403  parB-like partition protein  38.85 
 
 		 288 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4808  nuclease  33.79 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0027  parB-like partition protein  36.65 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3813  ParB-like nuclease  33.57 
 
 		 302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.112048  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0188  hypothetical protein  35.61 
 
 		 299 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905947 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1191  hypothetical protein  35.61 
 
 		 299 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3502  RepB plasmid partition  33.21 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.884798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2983  putative ParB-like partioning protein  34.29 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3173  parB-like partition protein  33.45 
 
 		 303 aa  149  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0076  stage 0 sporulation protein J, putative  41.38 
 
 		 213 aa  142  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.014387  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2747  stage 0 sporulation protein J, putative  43.55 
 
 		 136 aa  102  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  33.56 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  36.09 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  34.88 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  41.98 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  31.91 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  39.77 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0831  parB-like partition protein  44.44 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  41.67 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  38.78 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  32.06 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  31.1 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  30.56 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  39.77 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  41.98 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  34.09 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  34.33 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  31.85 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  35.66 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  40.62 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  42.25 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  38.26 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  38.64 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  38.64 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  43.66 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  43.66 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  45.07 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  33.33 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  39.29 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  30.41 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  31.69 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2951  hypothetical protein  42.86 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2805  hypothetical protein  42.86 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  43.66 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  38.78 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  39.29 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1319  chromosome segregation DNA-binding protein  27.32 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  29.3 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  30.88 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1059  parB-like partition proteins  27.47 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  30.82 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  30.82 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  36 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  34.41 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  43.66 
 
 		 290 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  36 
 
 		 286 aa  57  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  29.05 
 
 		 286 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  36.36 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  28.83 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4936  parB-like partition protein  35.83 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153012  normal  0.946011 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1582  nuclease  28.92 
 
 		 483 aa  55.8  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0050  parB-like partition protein  32.59 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  39.18 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2880  parB-like partition protein  32.79 
 
 		 368 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  34.04 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  37.04 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  33.04 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  33.04 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  30.14 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1732  stage 0 sporulation protein J  42.11 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  37.65 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  30.37 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  34.02 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3193  parB-like partition proteins  32.99 
 
 		 597 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  34.09 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  35.92 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0681  spoOJ protein  33.33 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  31.37 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  38.14 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  32.28 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3268  ParB family protein  25.28 
 
 		 565 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  32.28 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0940  parB-like partition protein  30.81 
 
 		 409 aa  54.3  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  32.28 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  32.28 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04091  ParB family protein  29.38 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00869743  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0065  chromosome partitioning protein  27.98 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.446293  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  32.28 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0033  ParB-like partition domain-containing protein  27.98 
 
 		 289 aa  53.5  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  32.28 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>