192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3813 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3813  ParB-like nuclease  100 
 
 		 302 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.112048  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3502  RepB plasmid partition  99.01 
 
 		 302 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.884798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0527  ParB family protein  56.36 
 
 		 299 aa  320  9.999999999999999e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0033  ParB family protein  46.83 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3173  parB-like partition protein  47.96 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1191  hypothetical protein  45.51 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0188  hypothetical protein  45.51 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905947 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0027  parB-like partition protein  47.37 
 
 		 300 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2983  putative ParB-like partioning protein  45.18 
 
 		 299 aa  239  5e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4808  nuclease  43.54 
 
 		 306 aa  235  6e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0831  parB-like partition protein  42.45 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1403  parB-like partition protein  43.17 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0771  ParB family protein  36.52 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0076  stage 0 sporulation protein J, putative  47.55 
 
 		 213 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.014387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2907  ParB family protein  33.57 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02511  ParB family protein  33.57 
 
 		 298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02475  hypothetical protein  33.57 
 
 		 298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2889  nuclease  32.75 
 
 		 298 aa  172  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.232082  normal  0.662657 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2747  stage 0 sporulation protein J, putative  47.29 
 
 		 136 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  34.68 
 
 		 529 aa  57.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  31.32 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  35.92 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  31.21 
 
 		 281 aa  55.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  30.08 
 
 		 281 aa  55.5  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  29.32 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  33.01 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  25.48 
 
 		 304 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  27.82 
 
 		 278 aa  52.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  29.86 
 
 		 312 aa  52.8  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  32.41 
 
 		 272 aa  52.8  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  26.14 
 
 		 321 aa  52.8  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  33.57 
 
 		 324 aa  52.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  32.37 
 
 		 306 aa  52.4  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  27.95 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  30.28 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  31.45 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  35.09 
 
 		 392 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  28.26 
 
 		 293 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0940  parB-like partition protein  30.43 
 
 		 409 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0831  parB-like partition protein  33.61 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  28.19 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  32.94 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  32.77 
 
 		 282 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  26.7 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  31.08 
 
 		 391 aa  50.1  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3097  ParB family protein  27.08 
 
 		 668 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650807  decreased coverage  0.0000165149 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  30.34 
 
 		 296 aa  50.1  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5405  parB-like partition protein  29.29 
 
 		 477 aa  49.7  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.469576 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  31.01 
 
 		 283 aa  49.3  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  27.44 
 
 		 708 aa  49.7  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  26.42 
 
 		 706 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0451  parB-like partition protein  36.84 
 
 		 317 aa  49.3  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2880  parB-like partition protein  30.25 
 
 		 368 aa  49.3  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  29.74 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  32.32 
 
 		 330 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  31.33 
 
 		 684 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  32.32 
 
 		 330 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  32.32 
 
 		 330 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  24.61 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3719  parB-like partition protein  33.91 
 
 		 383 aa  48.9  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118734  hitchhiker  0.00185127 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  27.23 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  27.82 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  33.06 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  30.81 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  35.4 
 
 		 379 aa  48.1  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  28.68 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  32.46 
 
 		 294 aa  48.5  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2139  parB-like partition protein  31.62 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  31.47 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  26.28 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  26.99 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  31.16 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  32.23 
 
 		 684 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  27.69 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  25 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  30.97 
 
 		 358 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  29.41 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  27.17 
 
 		 310 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  35.11 
 
 		 268 aa  47  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  27.06 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  30.95 
 
 		 315 aa  47  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  30.72 
 
 		 683 aa  47  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  27.17 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  29.93 
 
 		 288 aa  47  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  27.53 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  27.06 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9049  parB-like partition protein  30.92 
 
 		 398 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.740864  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  30.77 
 
 		 690 aa  47  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  33.01 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  27.17 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  27.07 
 
 		 290 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  28 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  30.84 
 
 		 282 aa  46.6  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  30.86 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5942  parB-like partition protein  30.43 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  29.13 
 
 		 306 aa  46.2  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  29.63 
 
 		 294 aa  46.6  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  26.87 
 
 		 283 aa  46.2  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  34.83 
 
 		 305 aa  46.2  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  25.36 
 
 		 293 aa  46.2  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>