212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0033 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0033  ParB family protein  100 
 
 		 301 aa  608  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0527  ParB family protein  53.54 
 
 		 299 aa  313  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3813  ParB-like nuclease  46.83 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.112048  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3502  RepB plasmid partition  46.48 
 
 		 302 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.884798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1191  hypothetical protein  42.07 
 
 		 299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0188  hypothetical protein  42.07 
 
 		 299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905947 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2983  putative ParB-like partioning protein  41.38 
 
 		 299 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0027  parB-like partition protein  39.73 
 
 		 300 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4808  nuclease  40.34 
 
 		 306 aa  215  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0831  parB-like partition protein  39.07 
 
 		 288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02511  ParB family protein  39.93 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02475  hypothetical protein  39.93 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2907  ParB family protein  39.93 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1403  parB-like partition protein  38.71 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0771  ParB family protein  37.68 
 
 		 296 aa  196  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2889  nuclease  38.62 
 
 		 298 aa  195  9e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.232082  normal  0.662657 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3173  parB-like partition protein  36.43 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0076  stage 0 sporulation protein J, putative  44.95 
 
 		 213 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.014387  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2747  stage 0 sporulation protein J, putative  41.41 
 
 		 136 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  29.87 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  29.69 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  30.06 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  27.78 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  30.47 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  29.61 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  36.59 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  34.23 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  30.23 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  28.36 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  29.91 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  30.23 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  29.55 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  33.98 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  30.23 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  29.2 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  29.69 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3097  ParB family protein  29.29 
 
 		 668 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650807  decreased coverage  0.0000165149 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  28.48 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  28.09 
 
 		 314 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  30.47 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  31.75 
 
 		 278 aa  54.3  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2405  parB-like partition protein  33.82 
 
 		 268 aa  54.3  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  31.82 
 
 		 256 aa  53.5  0.000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  33.98 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9049  parB-like partition protein  32.17 
 
 		 398 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.740864  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0050  parB-like partition protein  29.45 
 
 		 315 aa  53.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4936  parB-like partition protein  28.65 
 
 		 298 aa  53.1  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153012  normal  0.946011 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  30.28 
 
 		 268 aa  52.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  32.43 
 
 		 305 aa  52.8  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  31.97 
 
 		 285 aa  52.4  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  30 
 
 		 274 aa  52.8  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  28.68 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  27.33 
 
 		 284 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  26.87 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  29.93 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  29.31 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3268  ParB family protein  26.26 
 
 		 565 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  30.07 
 
 		 280 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  31.29 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  30.91 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4306  ParB family protein  27.39 
 
 		 355 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  29.58 
 
 		 333 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2569  transcriptional regulator  27.97 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  32.54 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  28.39 
 
 		 305 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2275  parB-like partition proteins  31.01 
 
 		 605 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.174874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0031  chromosome segregation DNA-binding protein  26.94 
 
 		 331 aa  50.4  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0740536 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1162  ParB-like nuclease domain-containing protein  32.87 
 
 		 542 aa  50.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  28.37 
 
 		 283 aa  50.1  0.00004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  28.39 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  28.39 
 
 		 297 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  28.39 
 
 		 297 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  32.11 
 
 		 296 aa  50.1  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2139  parB-like partition protein  30.71 
 
 		 367 aa  50.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  28.87 
 
 		 315 aa  50.1  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  23.85 
 
 		 304 aa  50.1  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4477  plasmid partitioning protein  32.04 
 
 		 560 aa  50.1  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0558103  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  30.28 
 
 		 298 aa  50.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  30.56 
 
 		 321 aa  50.1  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  25.68 
 
 		 318 aa  50.1  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  37.5 
 
 		 323 aa  49.7  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  28.38 
 
 		 312 aa  49.7  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1370  ParB family protein  36.46 
 
 		 324 aa  49.3  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  31.25 
 
 		 286 aa  49.3  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  31.25 
 
 		 286 aa  49.3  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0096  ParB family chromosome partitioning protein  36.59 
 
 		 278 aa  48.9  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  28.91 
 
 		 295 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  28.91 
 
 		 295 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  28.91 
 
 		 295 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  28.91 
 
 		 295 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  28.91 
 
 		 295 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  28.91 
 
 		 295 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  28.91 
 
 		 295 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0108  ParB family chromosome partitioning protein  32.11 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  29.86 
 
 		 422 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0136  ParB family chromosome partitioning protein  36.59 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0050  parB-like partition protein  26.94 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.383845  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5405  parB-like partition protein  27.78 
 
 		 477 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.469576 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  29.51 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  28.93 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>