More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0831 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0831  parB-like partition protein  100 
 
 		 273 aa  562  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  33.51 
 
 		 283 aa  102  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  38.79 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  37.18 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  36.36 
 
 		 401 aa  100  3e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  37.34 
 
 		 294 aa  99.4  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  34.17 
 
 		 283 aa  99.4  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  36.13 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  37.58 
 
 		 358 aa  97.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  39.26 
 
 		 329 aa  96.7  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  39.26 
 
 		 335 aa  95.5  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  37.34 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  31.15 
 
 		 281 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  29.9 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1542  parB-like partition protein  33.54 
 
 		 294 aa  94.7  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000160995  unclonable  1.80022e-19 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  35.22 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  32.37 
 
 		 293 aa  94  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 294 aa  92.4  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  30.48 
 
 		 282 aa  92.4  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  34.62 
 
 		 302 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  29.51 
 
 		 281 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1887  parB-like partition protein  33.14 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  30.56 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  30.56 
 
 		 305 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  30.56 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  30.56 
 
 		 305 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  30.56 
 
 		 295 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  30.56 
 
 		 295 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  30.56 
 
 		 295 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  30.56 
 
 		 295 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  30.56 
 
 		 295 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  30.56 
 
 		 295 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  31.76 
 
 		 268 aa  90.5  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  30.56 
 
 		 295 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  33.71 
 
 		 379 aa  89.7  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  35.59 
 
 		 286 aa  90.1  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2139  parB-like partition protein  34.71 
 
 		 367 aa  90.1  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  34.04 
 
 		 290 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  34.04 
 
 		 290 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  34.04 
 
 		 290 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  34.04 
 
 		 290 aa  89.7  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  34.04 
 
 		 290 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  34.04 
 
 		 290 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  34.04 
 
 		 290 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  31.89 
 
 		 311 aa  89.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  30.98 
 
 		 302 aa  89  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 290 aa  89.4  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  37.96 
 
 		 294 aa  89  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  32.69 
 
 		 289 aa  89  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  37.96 
 
 		 294 aa  89  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  36.84 
 
 		 291 aa  88.6  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  39.55 
 
 		 314 aa  89  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  28.34 
 
 		 255 aa  89  9e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  30.98 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  33.95 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  30 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  31.89 
 
 		 313 aa  88.2  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  33.33 
 
 		 290 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  33.88 
 
 		 286 aa  88.6  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  33.33 
 
 		 290 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  35.36 
 
 		 309 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  33.54 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  31.49 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 323 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  36.76 
 
 		 282 aa  87.4  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  34.64 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0060  ParB family chromosome partioning protein  30.82 
 
 		 280 aa  87  3e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00610373  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  32.26 
 
 		 310 aa  87  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  32.39 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  38.96 
 
 		 319 aa  86.3  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  31.82 
 
 		 298 aa  86.3  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0065  chromosome partitioning protein  29.95 
 
 		 315 aa  86.3  6e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.446293  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0033  ParB-like partition domain-containing protein  32.21 
 
 		 289 aa  86.3  6e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  33.52 
 
 		 290 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  32.91 
 
 		 295 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2897  parB-like partition protein  34.39 
 
 		 314 aa  85.9  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.024041  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  30.81 
 
 		 292 aa  85.9  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  30.43 
 
 		 284 aa  85.5  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  31.85 
 
 		 303 aa  85.5  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  30.64 
 
 		 292 aa  85.5  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  33.76 
 
 		 283 aa  85.5  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  37.41 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  32.16 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  34.43 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  28.95 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0117  parB-like partition protein  36.69 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  36.43 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  33.17 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  29.69 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  37.23 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  33.83 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  32.96 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  32.62 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  30.1 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2927  parB-like partition protein  29.38 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  41.03 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  36.65 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  31.93 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>