More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5405 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5405  parB-like partition protein  100 
 
 		 477 aa  950    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.469576 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1320  nuclease  29.73 
 
 		 516 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  37.25 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  30.77 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  36.67 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  35.71 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  37.01 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  35.8 
 
 		 323 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  34.9 
 
 		 297 aa  75.9  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  36 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  31.77 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2927  parB-like partition protein  34.19 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  31.77 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  36.49 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  35.53 
 
 		 392 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  32.89 
 
 		 294 aa  72.8  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  33.81 
 
 		 296 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  36.87 
 
 		 324 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  32.45 
 
 		 300 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  37.13 
 
 		 319 aa  72  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  34.48 
 
 		 306 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  32.45 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  34.86 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  32.16 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  32.45 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  32.79 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  33.33 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  36.61 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  32.02 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  32.5 
 
 		 257 aa  69.3  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0105  effector of nucleoid occlusion Noc  36.13 
 
 		 322 aa  69.3  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000144978  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  34.18 
 
 		 285 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  31.27 
 
 		 282 aa  69.7  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  29.26 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  36.42 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  36.42 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  35.43 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  35.26 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  36.6 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  32.4 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  34.42 
 
 		 529 aa  68.6  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  30.43 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0940  parB-like partition protein  29.86 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  36.69 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  37.59 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  36.18 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  29.38 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  33.52 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  34.44 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  35.53 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  31.46 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  33.71 
 
 		 293 aa  66.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1191  hypothetical protein  29.35 
 
 		 299 aa  66.6  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  32.91 
 
 		 284 aa  66.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  32.69 
 
 		 289 aa  66.6  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0188  hypothetical protein  29.35 
 
 		 299 aa  66.6  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905947 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  32.23 
 
 		 274 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  33.71 
 
 		 293 aa  66.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4797  nuclease  29.95 
 
 		 531 aa  66.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  32 
 
 		 329 aa  66.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4936  parB-like partition protein  32.06 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153012  normal  0.946011 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  35.09 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  34.87 
 
 		 294 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  31.85 
 
 		 321 aa  65.9  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  30.06 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4642  parB-like partition protein  27.23 
 
 		 451 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  35 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1837  parB-like partition protein  33.14 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2513  hypothetical protein  27.78 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  35.42 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  29.05 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  35.92 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  31.58 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4506  parB-like partition protein  31.79 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  27.7 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  31.44 
 
 		 662 aa  63.9  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  29.49 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  33.14 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  25.5 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  25.44 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  32.3 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  34.46 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  32.78 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  35.29 
 
 		 690 aa  63.5  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  31.85 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  31.79 
 
 		 662 aa  63.2  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  30.97 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0060  ParB family chromosome partioning protein  28.4 
 
 		 280 aa  62.8  0.00000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00610373  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9165  plasmid partitioning protein  37.21 
 
 		 612 aa  62.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2643  hypothetical protein  27.22 
 
 		 263 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  24.44 
 
 		 283 aa  62.8  0.00000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2731  parB-like partition protein  35.25 
 
 		 279 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  33.81 
 
 		 305 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  31.21 
 
 		 306 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2788  parB-like partition protein  35.25 
 
 		 279 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  28.21 
 
 		 272 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  31.43 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  34.68 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2960  chromosome segregation DNA-binding protein  30.85 
 
 		 306 aa  62  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  30.64 
 
 		 261 aa  62.8  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>