More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1804 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1804  ParB-like partition protein  100 
 
 		 303 aa  617  1e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.593981  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  71.38 
 
 		 298 aa  429  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  70.33 
 
 		 298 aa  422  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  70.13 
 
 		 296 aa  414  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  66.78 
 
 		 295 aa  393  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  65.99 
 
 		 292 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1887  parB-like partition protein  63.76 
 
 		 294 aa  372  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  46.93 
 
 		 307 aa  238  8e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  43.61 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  43.38 
 
 		 296 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  42.95 
 
 		 303 aa  219  5e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  42.91 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  43.66 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  42.09 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  43.33 
 
 		 294 aa  212  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  41.08 
 
 		 282 aa  211  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  50.6 
 
 		 284 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  42.02 
 
 		 302 aa  209  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  40.65 
 
 		 310 aa  209  6e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0451  parB-like partition protein  43.38 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2030  parB-like partition protein  42.95 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.503614 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  39.73 
 
 		 299 aa  203  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  39.53 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  40.33 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  38 
 
 		 282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  39.19 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  40.86 
 
 		 279 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  40.6 
 
 		 278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  40.92 
 
 		 290 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  40.91 
 
 		 300 aa  196  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  40.92 
 
 		 290 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  37.84 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  41.69 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  39.13 
 
 		 281 aa  193  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  39.87 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  40.59 
 
 		 290 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  41.72 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  42.38 
 
 		 289 aa  192  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  37.58 
 
 		 298 aa  192  7e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  41.53 
 
 		 294 aa  192  8e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  35.93 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  35.93 
 
 		 283 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  39.87 
 
 		 290 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  41.42 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  39.46 
 
 		 285 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  36.27 
 
 		 283 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  38.54 
 
 		 305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  38.38 
 
 		 298 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  35.93 
 
 		 283 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  40.53 
 
 		 290 aa  189  4e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  36.61 
 
 		 283 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  36.27 
 
 		 283 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  41.56 
 
 		 296 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  39.53 
 
 		 290 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  36.03 
 
 		 283 aa  189  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  40.74 
 
 		 288 aa  189  7e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  38.82 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  40.6 
 
 		 279 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  35.93 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  38.49 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  38.8 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  40.27 
 
 		 279 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  39.53 
 
 		 283 aa  187  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  37.87 
 
 		 289 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  40.82 
 
 		 284 aa  186  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  38.26 
 
 		 292 aa  186  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  38.8 
 
 		 282 aa  185  9e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  36.79 
 
 		 280 aa  185  9e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  38 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  41.42 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  39.74 
 
 		 290 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  36.58 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  36.58 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  39.69 
 
 		 422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  40.73 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  40.92 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  36.89 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  38.95 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  39 
 
 		 321 aa  182  7e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  37.5 
 
 		 283 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  36.27 
 
 		 294 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  40.06 
 
 		 323 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  39.18 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  40.14 
 
 		 293 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  37.77 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  39.09 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  38.87 
 
 		 295 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  39.32 
 
 		 286 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  36.58 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  39.48 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  36.16 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  39.41 
 
 		 272 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  37.9 
 
 		 296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  38.14 
 
 		 306 aa  179  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  39.27 
 
 		 302 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  38.1 
 
 		 256 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  35.25 
 
 		 283 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  39.39 
 
 		 293 aa  178  9e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  38.28 
 
 		 291 aa  178  9e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  40.07 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>