More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2030 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2030  parB-like partition protein  100 
 
 		 311 aa  631  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.503614 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  51.49 
 
 		 307 aa  305  6e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  49.51 
 
 		 306 aa  301  9e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  48.49 
 
 		 296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  47.96 
 
 		 303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  50.57 
 
 		 304 aa  264  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  47.9 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  49.24 
 
 		 305 aa  256  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  44.33 
 
 		 302 aa  249  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  41.69 
 
 		 289 aa  236  5.0000000000000005e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1887  parB-like partition protein  46.46 
 
 		 294 aa  235  9e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  44.7 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  46.8 
 
 		 296 aa  233  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  43.33 
 
 		 298 aa  229  4e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  45.45 
 
 		 295 aa  229  5e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  45 
 
 		 298 aa  224  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  44.67 
 
 		 295 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  41.75 
 
 		 298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0451  parB-like partition protein  44.09 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  41.67 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  38.44 
 
 		 323 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  41.67 
 
 		 298 aa  215  7e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  41.33 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  42.28 
 
 		 286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  42.28 
 
 		 286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  38.78 
 
 		 283 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  38.78 
 
 		 283 aa  209  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  37.88 
 
 		 282 aa  209  5e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  41.28 
 
 		 295 aa  209  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  38.78 
 
 		 283 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  38.78 
 
 		 283 aa  208  9e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  39.73 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  38.14 
 
 		 283 aa  207  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  38.14 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  39.81 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  37.54 
 
 		 283 aa  206  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  38.44 
 
 		 283 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  42.97 
 
 		 256 aa  206  6e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  39.61 
 
 		 299 aa  205  8e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  40.13 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  39.67 
 
 		 286 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  39.06 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  39.46 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  38.1 
 
 		 283 aa  203  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1804  ParB-like partition protein  42.95 
 
 		 303 aa  203  3e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.593981  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  39.73 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  38.05 
 
 		 285 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  43.36 
 
 		 309 aa  202  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  39.39 
 
 		 290 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  39.39 
 
 		 290 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  42.57 
 
 		 256 aa  202  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  38.72 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  40.67 
 
 		 282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  36.91 
 
 		 290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  36.91 
 
 		 288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  38.59 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  41.9 
 
 		 333 aa  199  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  42.69 
 
 		 289 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  40.4 
 
 		 290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  43.97 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  40.4 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  40.07 
 
 		 290 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  36.24 
 
 		 289 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  38.44 
 
 		 285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  40.7 
 
 		 289 aa  195  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  40.07 
 
 		 302 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  39.53 
 
 		 294 aa  196  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  40.07 
 
 		 290 aa  195  9e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  36.77 
 
 		 283 aa  195  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  37.84 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  39 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  41.5 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  41.83 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  42.48 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  38.87 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  38.71 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  37.34 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  40.13 
 
 		 279 aa  192  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  37.91 
 
 		 272 aa  192  5e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  45.24 
 
 		 287 aa  192  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  42.31 
 
 		 422 aa  192  9e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  34.95 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  36.73 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  38.93 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  37.92 
 
 		 321 aa  190  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  41.86 
 
 		 329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  39.73 
 
 		 290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  37.88 
 
 		 281 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  40.2 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  39.14 
 
 		 294 aa  189  5e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  42.08 
 
 		 335 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  39.53 
 
 		 284 aa  189  7e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  37.46 
 
 		 315 aa  188  9e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  39.86 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  37.84 
 
 		 290 aa  188  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  38.18 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  37.84 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  37.16 
 
 		 293 aa  186  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  39.33 
 
 		 358 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  37.04 
 
 		 299 aa  186  5e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>