28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_06610 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_06610  ParB-like nuclease  100 
 
 		 336 aa  676    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00240  ParB-like nuclease  72.06 
 
 		 336 aa  442  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0826  ParB domain protein nuclease  41.99 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2187  ParB-like nuclease domain-containing protein  41.46 
 
 		 133 aa  61.6  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0756  hypothetical protein  37.08 
 
 		 133 aa  58.9  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3031  ParB domain protein nuclease  37.36 
 
 		 308 aa  57  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0813346  normal  0.0592019 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4529  nuclease  29.56 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  38.79 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12665  hypothetical protein  39.76 
 
 		 154 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.39723e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3186  parB-like partition protein  40 
 
 		 350 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000842796  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2588  ParB family protein  33.33 
 
 		 447 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0831  parB-like partition protein  47.37 
 
 		 273 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  37.5 
 
 		 282 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  33.06 
 
 		 279 aa  46.2  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0681  spoOJ protein  39.29 
 
 		 286 aa  45.8  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  34.02 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1166  nuclease  36.76 
 
 		 79 aa  45.1  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0108  ParB family chromosome partitioning protein  34.44 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0136  ParB family chromosome partitioning protein  34.44 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0096  ParB family chromosome partitioning protein  34.44 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0177  parB-like partition protein  49.12 
 
 		 350 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000490694  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  34.04 
 
 		 401 aa  44.3  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  38.37 
 
 		 256 aa  43.5  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3193  parB-like partition proteins  35 
 
 		 597 aa  43.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  39.08 
 
 		 324 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  39.08 
 
 		 358 aa  43.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  39.36 
 
 		 305 aa  42.7  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  31.4 
 
 		 298 aa  42.7  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>