More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1331 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1331  parB-like partition protein  100 
 
 
269 aa  544  1e-154  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000205229 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0831  parB-like partition protein  34.78 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  34.48 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  31.31 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  32.91 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  35.33 
 
 
401 aa  73.2  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  32.67 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22180  parB-like partition protein  34.01 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  34.11 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  33.33 
 
 
304 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  29.38 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2024  parB-like partition protein  29.93 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000382297  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  26.69 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  28.95 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  28.95 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  33.77 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  30.92 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  27.85 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  28.95 
 
 
291 aa  65.5  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  29.63 
 
 
317 aa  64.7  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0451  parB-like partition protein  32.67 
 
 
317 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  29.12 
 
 
280 aa  65.1  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0681  spoOJ protein  38.24 
 
 
286 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  28.95 
 
 
290 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  34.65 
 
 
422 aa  64.7  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  33.63 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  33.63 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  29.61 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  31.58 
 
 
255 aa  63.9  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  31.41 
 
 
269 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  36.13 
 
 
285 aa  63.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  26.97 
 
 
309 aa  62.8  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  32.92 
 
 
306 aa  63.2  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  30.07 
 
 
295 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  24.15 
 
 
321 aa  62.8  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  26.67 
 
 
302 aa  62.4  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  36.75 
 
 
283 aa  62.4  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  31.01 
 
 
287 aa  62.4  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  27.95 
 
 
307 aa  62.4  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  33.07 
 
 
324 aa  62.4  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  29.03 
 
 
288 aa  62.4  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  28.95 
 
 
289 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  25.49 
 
 
289 aa  62.4  0.000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  27.92 
 
 
296 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  29.37 
 
 
292 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2927  parB-like partition protein  29.8 
 
 
297 aa  61.6  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  34.78 
 
 
272 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  30.94 
 
 
328 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  33.08 
 
 
295 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  25 
 
 
294 aa  60.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  31.54 
 
 
305 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  29.03 
 
 
290 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  27.78 
 
 
297 aa  60.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  30.52 
 
 
281 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  32.48 
 
 
304 aa  60.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  28.27 
 
 
274 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  29.46 
 
 
261 aa  60.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1531  stage 0 sporulation protein J  40.38 
 
 
281 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  30.13 
 
 
284 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0060  ParB family chromosome partioning protein  31.82 
 
 
280 aa  59.7  0.00000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00610373  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  33.59 
 
 
286 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  28.18 
 
 
297 aa  59.7  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  29.69 
 
 
323 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  26.42 
 
 
294 aa  59.7  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  30.77 
 
 
279 aa  59.7  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  29.5 
 
 
283 aa  59.7  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0096  ParB family chromosome partitioning protein  38.61 
 
 
278 aa  59.3  0.00000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0108  ParB family chromosome partitioning protein  38.61 
 
 
278 aa  59.3  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  32.74 
 
 
297 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2422  parB-like partition protein  27.74 
 
 
285 aa  59.3  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568139 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  32.33 
 
 
295 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  32.33 
 
 
295 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  32.33 
 
 
295 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  26.97 
 
 
295 aa  59.3  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  32.33 
 
 
295 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  32.33 
 
 
295 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0136  ParB family chromosome partitioning protein  38.61 
 
 
278 aa  59.3  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  32.33 
 
 
295 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  26.35 
 
 
318 aa  59.3  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  32.33 
 
 
295 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  32.33 
 
 
305 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  33.06 
 
 
310 aa  59.3  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  32.74 
 
 
285 aa  59.3  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3667  parB-like partition protein  31.31 
 
 
293 aa  59.3  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  31.62 
 
 
282 aa  59.3  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  31.01 
 
 
303 aa  58.9  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  29.24 
 
 
290 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  37.72 
 
 
312 aa  58.9  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  32.33 
 
 
297 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  32.33 
 
 
297 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  32.33 
 
 
305 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  29.17 
 
 
279 aa  58.9  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  29.49 
 
 
279 aa  58.9  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  32.24 
 
 
294 aa  58.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  28.08 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2405  parB-like partition protein  30.3 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1887  parB-like partition protein  28.67 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  32.74 
 
 
297 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  25.12 
 
 
286 aa  58.5  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  33.33 
 
 
303 aa  58.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>