10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0644 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0644  ParB domain protein nuclease  100 
 
 		 271 aa  537  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4529  nuclease  39.33 
 
 		 270 aa  98.6  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1278  nuclease  32.32 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2122  nuclease  32.32 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3038  transcriptional regulator protein  30.19 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2588  ParB family protein  29.76 
 
 		 447 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2318  MT-A70 family protein  34.91 
 
 		 435 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0066  ParB, partition protein  36.36 
 
 		 279 aa  45.8  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002131 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  26.04 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6316  chromosome partitioning protein ParB  25 
 
 		 332 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>