More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0066 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0066  ParB, partition protein  100 
 
 		 279 aa  564  1e-160  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002131 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6316  chromosome partitioning protein ParB  29.69 
 
 		 332 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  31.28 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  26.45 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  27.41 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  30.08 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  25.45 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  27.2 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  25.23 
 
 		 290 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  25.23 
 
 		 290 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  27.75 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  28.76 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  27.87 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  31.29 
 
 		 268 aa  67  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  27.33 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  28.49 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  23.44 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6062  plasmid partitioning protein ParB  21.99 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  27.33 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  26.97 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  28.89 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  27.5 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  27.45 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  30.33 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  25.39 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5942  parB-like partition protein  28.42 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  29.74 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  28.89 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  29.1 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  30 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  24.63 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0008  ParB family partitioning protein  23.85 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0065  chromosome partitioning protein  26.92 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.446293  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  28.77 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  24.89 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  28.37 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  28.37 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  26.83 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0033  ParB-like partition domain-containing protein  26.92 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  30 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  25.97 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1586  parB-like partition protein  31.16 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  0.0130059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1865  parB-like partition protein  31.16 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0917667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1653  parB-like partition protein  31.16 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.854391 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  28.28 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  26.83 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  27.97 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  26.36 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0004  ParB family protein  25.77 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.177803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1025  parB-like partition protein  31.18 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  25.96 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  24.64 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  29 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  26.7 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  27.91 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  27.74 
 
 		 358 aa  58.9  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  27.69 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  25.47 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  32.77 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  25.95 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5407  parB-like partition protein  30.82 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  24.75 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  26.7 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  24.75 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  27.33 
 
 		 293 aa  57  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  28.81 
 
 		 323 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  28.5 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  29.51 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  27.33 
 
 		 293 aa  57  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  23.91 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  27.27 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  26.13 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  24.33 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  27.74 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  26.9 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  29.03 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  29.03 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  28 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  27.35 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  29.03 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  29.03 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  25.86 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  26.9 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  27.41 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  29.03 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  31.4 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0001  hypothetical protein  29.17 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.115851  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2643  hypothetical protein  31.5 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2513  hypothetical protein  31.5 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  23.95 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  28.5 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  26.09 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  24.26 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  25.91 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4296  parB-like partition protein  27.04 
 
 		 624 aa  55.5  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  1.40492e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  27.69 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  30.53 
 
 		 529 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  22.43 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  32.41 
 
 		 285 aa  54.7  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  25.49 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>