More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4296 on replicon NC_014149
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014149  Plim_4296  parB-like partition protein  100 
 
 		 624 aa  1277    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  1.40492e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  36.7 
 
 		 362 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  34.52 
 
 		 299 aa  108  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  34.87 
 
 		 272 aa  107  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  34.76 
 
 		 285 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  34.64 
 
 		 289 aa  102  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  31.86 
 
 		 303 aa  100  8e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  31.92 
 
 		 293 aa  100  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  36.09 
 
 		 422 aa  100  9e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  32.98 
 
 		 298 aa  100  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  32.16 
 
 		 297 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  35.54 
 
 		 278 aa  99.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  33 
 
 		 284 aa  99.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  34.95 
 
 		 296 aa  99  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  31.75 
 
 		 283 aa  99  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  34.71 
 
 		 255 aa  98.6  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  32.51 
 
 		 296 aa  97.8  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  33.51 
 
 		 288 aa  96.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  33.33 
 
 		 283 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  33.33 
 
 		 283 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  31.92 
 
 		 294 aa  95.5  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  31.84 
 
 		 287 aa  95.5  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  32.52 
 
 		 313 aa  95.1  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  33.33 
 
 		 283 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  33.99 
 
 		 292 aa  94.7  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  33.33 
 
 		 283 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  33.33 
 
 		 283 aa  94  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 283 aa  94  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  33.54 
 
 		 256 aa  93.2  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  33.33 
 
 		 283 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  33.33 
 
 		 283 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0015  parB-like partition protein  33.84 
 
 		 296 aa  92.4  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000218674  hitchhiker  0.000314098 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  34.13 
 
 		 283 aa  92.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  32.74 
 
 		 321 aa  92.8  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  33.49 
 
 		 309 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0018  parB-like partition protein  34.34 
 
 		 296 aa  92  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0417799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  33.54 
 
 		 256 aa  92  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  35.36 
 
 		 268 aa  91.7  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  30.84 
 
 		 286 aa  91.7  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  30.37 
 
 		 293 aa  91.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  29.33 
 
 		 293 aa  91.3  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  34.84 
 
 		 328 aa  91.3  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  33.81 
 
 		 334 aa  91.3  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  29.33 
 
 		 293 aa  91.3  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2569  transcriptional regulator  32.99 
 
 		 284 aa  91.3  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  34.94 
 
 		 303 aa  90.9  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  34.67 
 
 		 306 aa  90.9  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  32.69 
 
 		 319 aa  90.9  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  33.17 
 
 		 331 aa  90.9  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  35.87 
 
 		 279 aa  90.9  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  31.22 
 
 		 317 aa  90.9  7e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1025  parB-like partition protein  32.68 
 
 		 297 aa  90.9  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  31.82 
 
 		 292 aa  90.5  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  31.82 
 
 		 292 aa  90.5  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  35.54 
 
 		 303 aa  90.5  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  31.82 
 
 		 292 aa  90.5  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  31.82 
 
 		 292 aa  90.5  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  35.87 
 
 		 279 aa  90.1  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  34.91 
 
 		 401 aa  89.7  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  29.56 
 
 		 296 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  35.33 
 
 		 314 aa  90.1  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  31.09 
 
 		 306 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 302 aa  89.7  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  28.85 
 
 		 293 aa  89.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  33.84 
 
 		 294 aa  89.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  33.49 
 
 		 313 aa  89  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  30.26 
 
 		 311 aa  89  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  31.44 
 
 		 286 aa  89.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  33.73 
 
 		 282 aa  89  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  33.65 
 
 		 358 aa  89.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  31.03 
 
 		 297 aa  89.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  33.52 
 
 		 284 aa  89.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  31.53 
 
 		 282 aa  89  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  29.9 
 
 		 283 aa  89  3e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  34.72 
 
 		 311 aa  89  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  31.44 
 
 		 295 aa  88.2  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  32.96 
 
 		 282 aa  87.8  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  33.16 
 
 		 323 aa  88.2  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  30.16 
 
 		 283 aa  87.8  6e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  30.3 
 
 		 293 aa  87.4  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  30.81 
 
 		 290 aa  87.4  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  30.81 
 
 		 290 aa  87.4  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  32.35 
 
 		 294 aa  87.4  7e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  29.56 
 
 		 296 aa  87.4  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  28.23 
 
 		 309 aa  87.4  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  34.2 
 
 		 294 aa  87.4  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  34.2 
 
 		 294 aa  87.4  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  30.81 
 
 		 290 aa  87  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  30.81 
 
 		 290 aa  87  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2405  parB-like partition protein  33.13 
 
 		 268 aa  87  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  30.81 
 
 		 290 aa  87  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  31.44 
 
 		 301 aa  87  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  30.81 
 
 		 290 aa  87  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0136  ParB family chromosome partitioning protein  30.35 
 
 		 278 aa  86.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  32.53 
 
 		 281 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  29.9 
 
 		 281 aa  86.7  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  30.3 
 
 		 290 aa  87  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  32.67 
 
 		 330 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  30.81 
 
 		 290 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  30.81 
 
 		 290 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>