More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1865 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1865  parB-like partition protein  100 
 
 		 298 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0917667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1586  parB-like partition protein  99.66 
 
 		 300 aa  579  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  0.0130059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1653  parB-like partition protein  97.65 
 
 		 300 aa  522  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.854391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1025  parB-like partition protein  71.38 
 
 		 297 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  68.24 
 
 		 297 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  69.36 
 
 		 306 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  52.2 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  52.2 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  52.54 
 
 		 293 aa  301  6.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  56.46 
 
 		 294 aa  294  9e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  54.24 
 
 		 288 aa  294  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  47.88 
 
 		 303 aa  291  1e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  51.86 
 
 		 293 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  51.86 
 
 		 293 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  50.67 
 
 		 296 aa  285  8e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  50.34 
 
 		 292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  51.82 
 
 		 298 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  53.36 
 
 		 294 aa  280  3e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  51.68 
 
 		 296 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1837  parB-like partition protein  54.69 
 
 		 305 aa  275  7e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  51.37 
 
 		 293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  51.84 
 
 		 296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  51.53 
 
 		 293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  52.17 
 
 		 296 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  50 
 
 		 303 aa  258  7e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  50 
 
 		 297 aa  256  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  46.74 
 
 		 299 aa  247  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  47.7 
 
 		 301 aa  246  4e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  45.18 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  48.62 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  49.48 
 
 		 301 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  46.36 
 
 		 319 aa  236  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  49.48 
 
 		 296 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  45.67 
 
 		 292 aa  225  7e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  45.18 
 
 		 292 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  39.53 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  44.97 
 
 		 296 aa  216  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2960  chromosome segregation DNA-binding protein  46.28 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  43.1 
 
 		 326 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  40.92 
 
 		 315 aa  212  5.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  44.37 
 
 		 298 aa  212  7e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  44.2 
 
 		 305 aa  209  4e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  44.93 
 
 		 298 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  44.59 
 
 		 298 aa  208  8e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  44.18 
 
 		 284 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2849  chromosome segregation DNA-binding protein  45.45 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573322  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  43.92 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  37.98 
 
 		 281 aa  206  3e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  44.56 
 
 		 306 aa  206  5e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  39.5 
 
 		 286 aa  205  9e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  44.97 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  37.59 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  46.26 
 
 		 323 aa  203  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  42.9 
 
 		 310 aa  202  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  42.62 
 
 		 305 aa  202  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  43.85 
 
 		 304 aa  202  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  43.06 
 
 		 279 aa  202  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  45.15 
 
 		 309 aa  202  8e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  41.52 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  48.63 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  43.06 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  41.7 
 
 		 284 aa  199  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  37.62 
 
 		 305 aa  198  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  44.26 
 
 		 312 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  44.31 
 
 		 422 aa  197  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  40.67 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  39.86 
 
 		 289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  45 
 
 		 333 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  44.06 
 
 		 329 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  40.75 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  38.49 
 
 		 289 aa  193  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  42.91 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  50.74 
 
 		 295 aa  193  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  44.86 
 
 		 321 aa  192  4e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  40.13 
 
 		 290 aa  192  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  40.48 
 
 		 284 aa  192  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  46 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  36.64 
 
 		 283 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  43.39 
 
 		 285 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  40.96 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  42.35 
 
 		 290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  41.3 
 
 		 286 aa  189  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  36.3 
 
 		 283 aa  189  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  37.88 
 
 		 283 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  39.08 
 
 		 295 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  40.69 
 
 		 303 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  37.37 
 
 		 283 aa  188  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  39.36 
 
 		 282 aa  188  8e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  42.2 
 
 		 290 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  38.79 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  41.9 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  44.29 
 
 		 294 aa  187  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  42.2 
 
 		 290 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  44.29 
 
 		 294 aa  187  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  36.99 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  40.34 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  36.55 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  36.55 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  42.76 
 
 		 306 aa  187  3e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  41.84 
 
 		 290 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>