More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2960 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2960  chromosome segregation DNA-binding protein  100 
 
 
306 aa  612  9.999999999999999e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  53.11 
 
 
299 aa  318  7e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  56.44 
 
 
297 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  51.82 
 
 
301 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  51.16 
 
 
300 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  53.06 
 
 
296 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  49.84 
 
 
301 aa  297  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  52.51 
 
 
303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  50.49 
 
 
292 aa  283  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  50.83 
 
 
293 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  49.17 
 
 
288 aa  280  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  50.17 
 
 
296 aa  278  7e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  49.35 
 
 
292 aa  278  8e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  49.83 
 
 
298 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1837  parB-like partition protein  51.44 
 
 
305 aa  276  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  49.17 
 
 
293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  49.17 
 
 
293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  49.18 
 
 
293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  50.17 
 
 
293 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  49.51 
 
 
296 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  48.38 
 
 
293 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  47.49 
 
 
299 aa  268  7e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  48.84 
 
 
294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  44.44 
 
 
303 aa  266  4e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2849  chromosome segregation DNA-binding protein  54.13 
 
 
298 aa  266  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573322  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  48.38 
 
 
297 aa  264  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  49.84 
 
 
296 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  47.56 
 
 
296 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  49.17 
 
 
294 aa  260  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  47.37 
 
 
293 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  47.74 
 
 
319 aa  256  3e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  46.82 
 
 
292 aa  255  7e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  47.54 
 
 
315 aa  255  8e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1025  parB-like partition protein  49.32 
 
 
297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  48.61 
 
 
326 aa  252  7e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  45.92 
 
 
296 aa  238  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  39.53 
 
 
283 aa  231  1e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  38.91 
 
 
281 aa  224  1e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  37.54 
 
 
283 aa  218  1e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1653  parB-like partition protein  46 
 
 
300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.854391 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1586  parB-like partition protein  45.67 
 
 
300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  0.0130059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1865  parB-like partition protein  44.81 
 
 
298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0917667 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  42.86 
 
 
306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  42.81 
 
 
274 aa  212  7.999999999999999e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  40.92 
 
 
284 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  40.98 
 
 
285 aa  206  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  41.22 
 
 
289 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  45.51 
 
 
306 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  42.62 
 
 
290 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  41.8 
 
 
298 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  41.19 
 
 
323 aa  202  7e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  41.61 
 
 
290 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  41.61 
 
 
290 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0018  parB-like partition protein  42.38 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0417799  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  42.28 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  41.95 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  40.8 
 
 
292 aa  200  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  40.98 
 
 
306 aa  199  6e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  38.87 
 
 
286 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  41.89 
 
 
290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  40.38 
 
 
310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  40.59 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  41.53 
 
 
256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  38.74 
 
 
272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  40.26 
 
 
314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  40.35 
 
 
294 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  40.35 
 
 
294 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  40 
 
 
290 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  41.18 
 
 
305 aa  195  7e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  43.51 
 
 
298 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  43.51 
 
 
298 aa  195  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  41.47 
 
 
309 aa  195  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  40 
 
 
290 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  40.34 
 
 
291 aa  194  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  39.27 
 
 
295 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  38.94 
 
 
297 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  38.94 
 
 
297 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  38.94 
 
 
305 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  40.26 
 
 
310 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  38.85 
 
 
289 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  38.61 
 
 
305 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  40.88 
 
 
298 aa  193  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  39.73 
 
 
290 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  38.73 
 
 
289 aa  193  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  39.73 
 
 
290 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  42.02 
 
 
298 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  41.25 
 
 
295 aa  193  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  40.26 
 
 
303 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  39.47 
 
 
295 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  39.47 
 
 
295 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  39.47 
 
 
295 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  39.47 
 
 
295 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  39.47 
 
 
295 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  39.47 
 
 
295 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  39.47 
 
 
295 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  39.66 
 
 
280 aa  192  6e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  40.38 
 
 
303 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  36.88 
 
 
305 aa  191  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  41.64 
 
 
290 aa  191  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  38.85 
 
 
304 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>