More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1653 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1653  parB-like partition protein  100 
 
 		 300 aa  585  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.854391 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1586  parB-like partition protein  98 
 
 		 300 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  0.0130059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1865  parB-like partition protein  97.65 
 
 		 298 aa  523  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0917667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1025  parB-like partition protein  71.38 
 
 		 297 aa  391  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  68.58 
 
 		 297 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  69.02 
 
 		 306 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  52.2 
 
 		 293 aa  305  8.000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  52.2 
 
 		 293 aa  305  8.000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  52.54 
 
 		 293 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  55.89 
 
 		 294 aa  295  7e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  53.56 
 
 		 288 aa  293  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  47.4 
 
 		 303 aa  290  2e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  52.2 
 
 		 293 aa  289  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  50.34 
 
 		 296 aa  286  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  52.2 
 
 		 293 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  50.68 
 
 		 292 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  51.64 
 
 		 298 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  52.68 
 
 		 294 aa  278  5e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1837  parB-like partition protein  55.31 
 
 		 305 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  51.16 
 
 		 296 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  51.67 
 
 		 296 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  51.19 
 
 		 293 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  51.19 
 
 		 293 aa  272  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  50.17 
 
 		 303 aa  267  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  51.85 
 
 		 296 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  49.48 
 
 		 297 aa  255  5e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  47.08 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  47.04 
 
 		 301 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  49.48 
 
 		 301 aa  242  5e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  49.48 
 
 		 296 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  44.52 
 
 		 299 aa  239  5e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  46.64 
 
 		 319 aa  238  9e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  48.45 
 
 		 300 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  44.67 
 
 		 292 aa  228  7e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  45.67 
 
 		 292 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  44.55 
 
 		 296 aa  219  5e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  39.19 
 
 		 283 aa  216  4e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  43.1 
 
 		 326 aa  215  7e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2960  chromosome segregation DNA-binding protein  46 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  41.39 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2849  chromosome segregation DNA-binding protein  46.82 
 
 		 298 aa  209  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573322  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  44.2 
 
 		 305 aa  209  4e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  43.97 
 
 		 298 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  46.98 
 
 		 323 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  43.77 
 
 		 279 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  43.84 
 
 		 284 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  37.63 
 
 		 281 aa  206  4e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  43.77 
 
 		 279 aa  206  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  42.09 
 
 		 305 aa  206  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  44.26 
 
 		 298 aa  205  6e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  39.15 
 
 		 286 aa  205  6e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  43.92 
 
 		 298 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  43 
 
 		 310 aa  205  8e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  44.22 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  37.24 
 
 		 283 aa  203  3e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  49.02 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  44.52 
 
 		 304 aa  202  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  43.24 
 
 		 298 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  45.15 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  43.87 
 
 		 307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  41.18 
 
 		 272 aa  200  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  37.29 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  45 
 
 		 333 aa  195  7e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  40.99 
 
 		 284 aa  195  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  43.58 
 
 		 312 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  40.67 
 
 		 295 aa  195  9e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  42.69 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  41.16 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  42.35 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  39.93 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  39.5 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  43.69 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  40.41 
 
 		 294 aa  193  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  41.16 
 
 		 284 aa  192  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  44.37 
 
 		 321 aa  192  5e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  42.97 
 
 		 295 aa  192  7e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  40.27 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  45.6 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  42.35 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  43.25 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  41.24 
 
 		 286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  41.99 
 
 		 290 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  42.91 
 
 		 329 aa  189  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  41.99 
 
 		 290 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  40.34 
 
 		 303 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  41.55 
 
 		 305 aa  189  7e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  37.01 
 
 		 283 aa  188  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  36.3 
 
 		 283 aa  188  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  38.73 
 
 		 295 aa  187  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  40.07 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  35.96 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  36.21 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  40 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  38.43 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  41.64 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  39.86 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  37.54 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  36.21 
 
 		 283 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  38.81 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  39.32 
 
 		 290 aa  186  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>