104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0372 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0372  ParB-like nuclease  100 
 
 
281 aa  557  1e-158  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3691  hypothetical protein  38.4 
 
 
361 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4212  nuclease  36.14 
 
 
367 aa  148  9e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.789565  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3405  ParB-like nuclease  36.36 
 
 
360 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3492  nuclease  34.93 
 
 
361 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0639009  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1422  ParB-like nuclease  36.02 
 
 
361 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3856  nuclease  37.97 
 
 
391 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.465439  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4264  ParB-like nuclease  37.34 
 
 
321 aa  93.6  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.373587 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3774  ParB-like nuclease  36.36 
 
 
376 aa  92  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.142601  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4083  nuclease  37.75 
 
 
368 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.214085 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7084  ParB-like nuclease  35.67 
 
 
371 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.403712  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4243  hypothetical protein  36.24 
 
 
352 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.444591 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2912  replication protein, putative  32.23 
 
 
369 aa  68.9  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.595815  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7211  RepB partitioning protein/ParB-like protein  32.57 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4321  hypothetical protein  32.57 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.185891 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3847  nuclease  35.5 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.298073  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  30.53 
 
 
256 aa  54.7  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0831  parB-like partition protein  34.21 
 
 
273 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  33.58 
 
 
286 aa  53.5  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0096  ParB family chromosome partitioning protein  39.78 
 
 
278 aa  52.8  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0136  ParB family chromosome partitioning protein  39.78 
 
 
278 aa  52.4  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0108  ParB family chromosome partitioning protein  39.78 
 
 
278 aa  52.8  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3820  parB-like partition proteins  34.68 
 
 
564 aa  52.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.621795  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 
298 aa  52.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  36.26 
 
 
303 aa  51.6  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  34.68 
 
 
306 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  39.33 
 
 
305 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  35.25 
 
 
303 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  33.33 
 
 
314 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  30.43 
 
 
358 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1191  hypothetical protein  32.73 
 
 
299 aa  50.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0188  hypothetical protein  32.73 
 
 
299 aa  50.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0905947 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  37.36 
 
 
310 aa  50.1  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  36.26 
 
 
302 aa  49.7  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  35.71 
 
 
294 aa  49.3  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  34.78 
 
 
288 aa  48.9  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  34.04 
 
 
255 aa  49.3  0.00008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  34.43 
 
 
303 aa  48.9  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1162  ParB-like nuclease domain-containing protein  26.67 
 
 
542 aa  48.5  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0027  parB-like partition protein  32.11 
 
 
300 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  34.43 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  34.43 
 
 
283 aa  48.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2983  putative ParB-like partioning protein  32.54 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  34.19 
 
 
335 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  29.08 
 
 
294 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  29.08 
 
 
294 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5405  parB-like partition protein  35.05 
 
 
477 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.469576 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  32.59 
 
 
295 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  33.33 
 
 
329 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  37.23 
 
 
268 aa  47  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9049  parB-like partition protein  35.04 
 
 
398 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.740864  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  29.29 
 
 
289 aa  47  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2588  ParB family protein  33.04 
 
 
447 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1804  ParB-like partition protein  36.67 
 
 
303 aa  46.6  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.593981  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  37.5 
 
 
307 aa  46.2  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  35.04 
 
 
330 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  35.04 
 
 
330 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  35.04 
 
 
330 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  32.86 
 
 
295 aa  45.8  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  36.21 
 
 
367 aa  45.8  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  32.76 
 
 
391 aa  45.8  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4975  parB-like partition protein  37.8 
 
 
311 aa  45.8  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  36.04 
 
 
290 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  31.09 
 
 
284 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6444  ParB family protein  33.33 
 
 
349 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6603  parB-like partition proteins  33.33 
 
 
349 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  30.71 
 
 
323 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  31.9 
 
 
331 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  35.11 
 
 
294 aa  45.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  32.35 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  29.79 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4217  parB-like partition protein  31.3 
 
 
472 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2889  nuclease  35.71 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.232082  normal  0.662657 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  31.85 
 
 
295 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  35.14 
 
 
290 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6062  plasmid partitioning protein ParB  31.36 
 
 
369 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1396  parB-like partition protein  38.89 
 
 
362 aa  43.9  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0186141  hitchhiker  0.0000927483 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  29.06 
 
 
280 aa  43.9  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2880  parB-like partition protein  31.48 
 
 
368 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4698  parB-like partition proteins  35.54 
 
 
368 aa  43.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  29.17 
 
 
292 aa  43.5  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0681  spoOJ protein  35.58 
 
 
286 aa  43.5  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  28.87 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  32.73 
 
 
290 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  28.35 
 
 
292 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  31.78 
 
 
285 aa  43.5  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  35.48 
 
 
295 aa  43.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4936  parB-like partition protein  31.07 
 
 
298 aa  43.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153012  normal  0.946011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4529  nuclease  31.54 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  35.29 
 
 
294 aa  43.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  33.64 
 
 
302 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0358  stage 0 sporulation protein J  37.11 
 
 
286 aa  42.7  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000194185  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  28.47 
 
 
288 aa  42.7  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  35.23 
 
 
296 aa  42.7  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  33.64 
 
 
290 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  31.62 
 
 
296 aa  42.7  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  27.34 
 
 
298 aa  42.7  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  35.51 
 
 
304 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  35.63 
 
 
298 aa  42.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  32.73 
 
 
290 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>