61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4264 on replicon NC_007801
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007801  Jann_4264  ParB-like nuclease  100 
 
 		 321 aa  623  1e-177  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.373587 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4243  hypothetical protein  41.6 
 
 		 352 aa  208  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.444591 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3774  ParB-like nuclease  36.97 
 
 		 376 aa  189  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.142601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7084  ParB-like nuclease  44.75 
 
 		 371 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.403712  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4083  nuclease  45.6 
 
 		 368 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.214085 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3856  nuclease  43.82 
 
 		 391 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.465439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3405  ParB-like nuclease  38.26 
 
 		 360 aa  161  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1422  ParB-like nuclease  45.34 
 
 		 361 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3492  nuclease  45.34 
 
 		 361 aa  159  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0639009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3691  hypothetical protein  43.75 
 
 		 361 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4212  nuclease  39.16 
 
 		 367 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.789565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7211  RepB partitioning protein/ParB-like protein  34.47 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0372  ParB-like nuclease  32.23 
 
 		 281 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4321  hypothetical protein  36.27 
 
 		 350 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.185891 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3847  nuclease  33.48 
 
 		 374 aa  93.6  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.298073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2912  replication protein, putative  35.12 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.595815  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  40 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  28.29 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  35.1 
 
 		 274 aa  57  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  34.23 
 
 		 322 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  33.33 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  31.75 
 
 		 347 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  32.14 
 
 		 333 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  25.48 
 
 		 335 aa  52.8  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  38.71 
 
 		 329 aa  52.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  35.77 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  29.69 
 
 		 333 aa  50.4  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  37.29 
 
 		 336 aa  50.4  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  30.37 
 
 		 360 aa  50.1  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  33.33 
 
 		 345 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  33.54 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  37.37 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  31.58 
 
 		 350 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  35.79 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  27.36 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  32.54 
 
 		 331 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  31.34 
 
 		 328 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  27.36 
 
 		 328 aa  47.4  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  30.99 
 
 		 331 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29862 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  41.9 
 
 		 333 aa  46.2  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  36.17 
 
 		 349 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  29.33 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5942  parB-like partition protein  40.86 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  36.23 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2927  parB-like partition protein  34.91 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  30.99 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0831  parB-like partition protein  31.09 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2588  ParB family protein  30.56 
 
 		 447 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  32.26 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0066  ParB, partition protein  32 
 
 		 279 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002131 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  34.81 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4936  parB-like partition protein  33.61 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153012  normal  0.946011 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  31.01 
 
 		 322 aa  43.9  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6062  plasmid partitioning protein ParB  25.73 
 
 		 369 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  31.19 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  29.53 
 
 		 339 aa  43.5  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  28.25 
 
 		 328 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  24.55 
 
 		 281 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  30.38 
 
 		 340 aa  43.1  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  32.71 
 
 		 294 aa  43.1  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>