88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3492 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3492  nuclease  100 
 
 		 361 aa  695    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0639009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1422  ParB-like nuclease  99.72 
 
 		 361 aa  693    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3691  hypothetical protein  84.96 
 
 		 361 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4212  nuclease  50.42 
 
 		 367 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.789565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3405  ParB-like nuclease  46.87 
 
 		 360 aa  272  5.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3856  nuclease  49.55 
 
 		 391 aa  179  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.465439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4243  hypothetical protein  41.46 
 
 		 352 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.444591 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7084  ParB-like nuclease  48.21 
 
 		 371 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.403712  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3774  ParB-like nuclease  37.46 
 
 		 376 aa  166  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.142601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4083  nuclease  48.42 
 
 		 368 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.214085 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4264  ParB-like nuclease  49.21 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.373587 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0372  ParB-like nuclease  34.93 
 
 		 281 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7211  RepB partitioning protein/ParB-like protein  44.66 
 
 		 350 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4321  hypothetical protein  43.33 
 
 		 350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.185891 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2912  replication protein, putative  38.24 
 
 		 369 aa  96.7  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.595815  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3847  nuclease  35 
 
 		 374 aa  93.2  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.298073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  38.24 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  29.1 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  33.33 
 
 		 333 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  30.88 
 
 		 328 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  33.86 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  31.65 
 
 		 322 aa  54.3  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  33.76 
 
 		 326 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  34.35 
 
 		 256 aa  53.9  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0831  parB-like partition protein  30.08 
 
 		 273 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4293  parB-like partition proteins  36.36 
 
 		 583 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.407896 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  35.42 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  35.61 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  31.39 
 
 		 280 aa  51.2  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2588  ParB family protein  30.7 
 
 		 447 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2139  parB-like partition protein  39.09 
 
 		 367 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  31.69 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  32.93 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4710  parB-like partition protein  37.97 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  41.67 
 
 		 286 aa  47.8  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  34.92 
 
 		 305 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  31.03 
 
 		 358 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  39.13 
 
 		 274 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  34.12 
 
 		 312 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  34.85 
 
 		 333 aa  47  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  29.08 
 
 		 302 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  32.91 
 
 		 323 aa  47  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0619  hypothetical protein  28.73 
 
 		 510 aa  46.6  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  33.98 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  30.87 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9049  parB-like partition protein  29.44 
 
 		 398 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.740864  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4454  hypothetical protein  37.23 
 
 		 575 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  31.66 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1531  stage 0 sporulation protein J  35.42 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1762  parB-like partition protein  34.43 
 
 		 334 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  34.42 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  35.66 
 
 		 315 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  37.74 
 
 		 322 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2995  hypothetical protein  36.26 
 
 		 528 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0189  chromosome partitioning protein ParB  33.33 
 
 		 283 aa  44.3  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.807287  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  35.64 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  34.38 
 
 		 281 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  32.37 
 
 		 290 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  31.73 
 
 		 274 aa  44.3  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  32 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3746  hypothetical protein  28.57 
 
 		 548 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  38.54 
 
 		 296 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5942  parB-like partition protein  30.18 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 280 aa  44.3  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0478  hypothetical protein  37.74 
 
 		 574 aa  44.3  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  34.06 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3379  hypothetical protein  36.21 
 
 		 554 aa  43.9  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60985  normal  0.431334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4114  hypothetical protein  30.22 
 
 		 581 aa  43.9  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  37.5 
 
 		 290 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  34.96 
 
 		 340 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  28.32 
 
 		 283 aa  43.9  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  37.5 
 
 		 290 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0997  hypothetical protein  40.22 
 
 		 552 aa  43.9  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  32.12 
 
 		 290 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  31.58 
 
 		 325 aa  43.5  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1664  hypothetical protein  37.74 
 
 		 574 aa  43.1  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  36.36 
 
 		 316 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  30.5 
 
 		 284 aa  43.1  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  35.48 
 
 		 323 aa  43.1  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  34.51 
 
 		 290 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  31.76 
 
 		 289 aa  43.1  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  31.93 
 
 		 295 aa  42.7  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9002  replication protein B  33.33 
 
 		 325 aa  42.7  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  34.51 
 
 		 298 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0608  hypothetical protein  31.03 
 
 		 574 aa  42.7  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4468  parB-like partition proteins  37.7 
 
 		 363 aa  42.7  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.99602  hitchhiker  7.6726e-17 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  35.14 
 
 		 303 aa  42.7  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2334  hypothetical protein  39.13 
 
 		 552 aa  42.7  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>