227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3405 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3405  ParB-like nuclease  100 
 
 		 360 aa  712    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3492  nuclease  46.87 
 
 		 361 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0639009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1422  ParB-like nuclease  50.97 
 
 		 361 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3691  hypothetical protein  50 
 
 		 361 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4212  nuclease  45.83 
 
 		 367 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.789565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3856  nuclease  37.11 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.465439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3774  ParB-like nuclease  36.74 
 
 		 376 aa  152  7e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.142601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7084  ParB-like nuclease  36.7 
 
 		 371 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.403712  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4083  nuclease  36.33 
 
 		 368 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.214085 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4243  hypothetical protein  37.86 
 
 		 352 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.444591 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4264  ParB-like nuclease  38.54 
 
 		 321 aa  149  9e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.373587 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0372  ParB-like nuclease  36.36 
 
 		 281 aa  144  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3847  nuclease  33.82 
 
 		 374 aa  106  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.298073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4321  hypothetical protein  33.33 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.185891 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7211  RepB partitioning protein/ParB-like protein  34.47 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2912  replication protein, putative  31.53 
 
 		 369 aa  99.4  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.595815  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  38.89 
 
 		 281 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  44.64 
 
 		 283 aa  67  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  37.04 
 
 		 281 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  39.32 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  39.32 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  41.28 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  42.86 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2411  ParB domain protein nuclease  42.22 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000114974  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  30.93 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  29.41 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  39.45 
 
 		 284 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4698  parB-like partition proteins  40.37 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  40.19 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  31.3 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0831  parB-like partition protein  33.63 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  37.93 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  32.41 
 
 		 290 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  32.41 
 
 		 290 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  32.41 
 
 		 290 aa  57  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  32.41 
 
 		 290 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  32.41 
 
 		 290 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2139  parB-like partition protein  37.96 
 
 		 367 aa  57  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2927  parB-like partition protein  38.89 
 
 		 297 aa  57  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  32.41 
 
 		 290 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  38.74 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  32.41 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5824  parB-like partition protein  27.66 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  39.25 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  36.17 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0358  stage 0 sporulation protein J  35.66 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000194185  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  32.87 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  32.41 
 
 		 290 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  34.35 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  34.78 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  32.41 
 
 		 290 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  38.54 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  35.4 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  36.13 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  36.45 
 
 		 283 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  32.59 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  37.36 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  32.59 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5407  parB-like partition protein  40.43 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  37.23 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  34.82 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  37.36 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  33.04 
 
 		 290 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  37.36 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  37.36 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  37.36 
 
 		 294 aa  54.7  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  37.36 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  37.74 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  35.96 
 
 		 298 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  37.36 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  33.04 
 
 		 290 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  37.36 
 
 		 305 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  37.36 
 
 		 305 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  37.74 
 
 		 295 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  37.36 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  37.36 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  37.36 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  37.36 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  37.36 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  38.54 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  34.55 
 
 		 290 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  37.23 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  38.46 
 
 		 304 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5942  parB-like partition protein  38.3 
 
 		 295 aa  53.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  38.3 
 
 		 268 aa  53.5  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  30.92 
 
 		 303 aa  53.5  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  30.5 
 
 		 302 aa  53.5  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  33.63 
 
 		 292 aa  53.5  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  31.03 
 
 		 309 aa  53.1  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  38.3 
 
 		 255 aa  53.5  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  33.11 
 
 		 312 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  31.48 
 
 		 296 aa  53.1  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  39.58 
 
 		 310 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  37.5 
 
 		 295 aa  52.8  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  32.43 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  35.59 
 
 		 294 aa  52.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2877  parB-like partition proteins  38.21 
 
 		 287 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.754153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  40.18 
 
 		 280 aa  52.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  35.16 
 
 		 331 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  35.29 
 
 		 329 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>