154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2411 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2411  ParB domain protein nuclease  100 
 
 
284 aa  569  1e-161  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000114974  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0935  ParB domain protein nuclease  36.13 
 
 
307 aa  149  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.167153 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1523  ParB domain protein nuclease  41.42 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.10423 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3405  ParB-like nuclease  42.22 
 
 
360 aa  60.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  40.51 
 
 
401 aa  55.8  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  36.7 
 
 
379 aa  53.1  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  34.71 
 
 
309 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  38.95 
 
 
295 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  39.18 
 
 
292 aa  52  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  46.15 
 
 
303 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  35.44 
 
 
312 aa  50.8  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  37 
 
 
317 aa  50.4  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  37.89 
 
 
422 aa  50.4  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  43.37 
 
 
303 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  40 
 
 
310 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2569  transcriptional regulator  31.09 
 
 
284 aa  50.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2139  parB-like partition protein  35.43 
 
 
367 aa  50.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  35.78 
 
 
331 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  37.89 
 
 
295 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  43.37 
 
 
303 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1887  parB-like partition protein  36.73 
 
 
294 aa  50.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  41.89 
 
 
295 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  41.89 
 
 
295 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  41.89 
 
 
295 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  41.89 
 
 
295 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  41.89 
 
 
295 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  41.89 
 
 
295 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  41.89 
 
 
295 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  41.89 
 
 
305 aa  49.7  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  41.89 
 
 
297 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  41.89 
 
 
305 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  41.89 
 
 
305 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  36.84 
 
 
298 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  41.89 
 
 
297 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  36.14 
 
 
282 aa  49.7  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  41.89 
 
 
297 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  39.24 
 
 
297 aa  48.9  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  40.54 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3163  parB-like partition protein  26.04 
 
 
352 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  30.21 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  31.25 
 
 
281 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  32.48 
 
 
294 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  32.48 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  36.45 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  33.33 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  37.37 
 
 
362 aa  47.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0123  ParB family protein  35.29 
 
 
328 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  37.65 
 
 
298 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  32.58 
 
 
302 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  34.74 
 
 
296 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  35.71 
 
 
298 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  39.74 
 
 
284 aa  47  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  35.71 
 
 
298 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  38.3 
 
 
319 aa  47.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  35.14 
 
 
293 aa  47  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5942  parB-like partition protein  33.88 
 
 
295 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2405  parB-like partition protein  31.35 
 
 
268 aa  47.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  33.33 
 
 
305 aa  46.6  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  43.28 
 
 
307 aa  47  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  36.73 
 
 
298 aa  46.6  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9049  parB-like partition protein  36 
 
 
398 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.740864  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6576  parB-like partition protein  35.44 
 
 
324 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152198  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  35.79 
 
 
292 aa  46.6  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  37.36 
 
 
295 aa  46.6  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  35.96 
 
 
286 aa  46.6  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  34.88 
 
 
282 aa  46.6  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2805  hypothetical protein  39.24 
 
 
289 aa  46.2  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  37.08 
 
 
293 aa  46.2  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  32.82 
 
 
304 aa  46.2  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1331  parB-like partition protein  29.79 
 
 
269 aa  46.2  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000205229 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  34.21 
 
 
296 aa  46.2  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  31.18 
 
 
290 aa  45.8  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  31.18 
 
 
290 aa  45.8  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  31.18 
 
 
290 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2951  hypothetical protein  39.24 
 
 
301 aa  45.8  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  32.65 
 
 
295 aa  46.2  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  31.18 
 
 
290 aa  45.8  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  31.18 
 
 
290 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  30.85 
 
 
290 aa  45.8  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  30.85 
 
 
290 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  31.03 
 
 
278 aa  45.8  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  31.9 
 
 
279 aa  45.8  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4293  parB-like partition proteins  31.18 
 
 
583 aa  45.8  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.407896 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5423  parB-like partition protein  35.29 
 
 
324 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  34.48 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0008  ParB family partitioning protein  39.34 
 
 
294 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2643  hypothetical protein  32.43 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2513  hypothetical protein  32.43 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  30.25 
 
 
284 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  34.21 
 
 
306 aa  45.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  38.67 
 
 
282 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3719  parB-like partition protein  40.26 
 
 
383 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118734  hitchhiker  0.00185127 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 
296 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3667  parB-like partition protein  34 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  37.89 
 
 
303 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3847  nuclease  39.06 
 
 
374 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.298073  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  39.29 
 
 
297 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  30.85 
 
 
290 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  33.02 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  32.23 
 
 
333 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>