More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5423 on replicon NC_011880
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011880  Cyan7425_5423  parB-like partition protein  100 
 
 
324 aa  653    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5493  parB-like partition protein  45.82 
 
 
311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.204512 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0021  ParB family protein  38.18 
 
 
320 aa  179  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0123  ParB family protein  38.57 
 
 
328 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5824  parB-like partition protein  41.49 
 
 
312 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3389  hypothetical protein  38.46 
 
 
296 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39686  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3667  parB-like partition protein  40 
 
 
293 aa  142  7e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2476  parB-like partition proteins  33.58 
 
 
303 aa  129  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.751865  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2494  parB-like partition proteins  32.03 
 
 
291 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  31.3 
 
 
296 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5559  parB-like partition protein  47.83 
 
 
400 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  33 
 
 
292 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  41.41 
 
 
293 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  32.29 
 
 
422 aa  101  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  29.84 
 
 
278 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  41.41 
 
 
293 aa  99  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  30.22 
 
 
290 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  30.22 
 
 
290 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  31.32 
 
 
272 aa  95.9  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  29.89 
 
 
282 aa  95.1  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  29.89 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  29.89 
 
 
290 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  28.17 
 
 
297 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  32.99 
 
 
298 aa  92.4  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  44.86 
 
 
281 aa  92.4  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  39.69 
 
 
293 aa  92  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2805  hypothetical protein  30.42 
 
 
289 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  30.6 
 
 
298 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  30.6 
 
 
298 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  39.69 
 
 
293 aa  92  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  28.74 
 
 
274 aa  92  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  41.38 
 
 
401 aa  91.7  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  30.47 
 
 
298 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  33.82 
 
 
296 aa  90.9  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  28.98 
 
 
306 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0001  hypothetical protein  31.55 
 
 
291 aa  90.9  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.115851  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  31.18 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  31.28 
 
 
298 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  30.04 
 
 
294 aa  90.1  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  30.3 
 
 
294 aa  90.5  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  43.93 
 
 
328 aa  89.4  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  29.39 
 
 
310 aa  89.4  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  32.64 
 
 
305 aa  89.4  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  32.02 
 
 
304 aa  89  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  32.64 
 
 
297 aa  89  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  32.64 
 
 
297 aa  89  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  30.67 
 
 
305 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  35.44 
 
 
293 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2951  hypothetical protein  30.04 
 
 
301 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  30.65 
 
 
296 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  40 
 
 
296 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  37.41 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  27.62 
 
 
286 aa  88.6  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  29.62 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  31.53 
 
 
323 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  29.97 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  32.64 
 
 
305 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  28.29 
 
 
335 aa  87.8  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  30.77 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  30.34 
 
 
295 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  29.62 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  30.9 
 
 
269 aa  87.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  43.7 
 
 
297 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  27.24 
 
 
294 aa  87.4  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  32.16 
 
 
315 aa  87.8  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  43.7 
 
 
305 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  29.44 
 
 
295 aa  87  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2643  hypothetical protein  37.5 
 
 
263 aa  87  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2513  hypothetical protein  37.5 
 
 
263 aa  87  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  32.18 
 
 
286 aa  87  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  31.19 
 
 
322 aa  86.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  40.77 
 
 
303 aa  86.3  6e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  31.07 
 
 
303 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  30.09 
 
 
286 aa  86.7  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  29.88 
 
 
329 aa  86.3  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  29.02 
 
 
286 aa  86.3  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  28.46 
 
 
306 aa  85.9  8e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  34.85 
 
 
297 aa  85.9  8e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  32.02 
 
 
283 aa  85.9  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  31.38 
 
 
321 aa  85.9  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  45.63 
 
 
295 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  42.86 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  30.28 
 
 
296 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  45.63 
 
 
295 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  45.63 
 
 
295 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  42.99 
 
 
290 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  30.28 
 
 
301 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  45.63 
 
 
295 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  29.65 
 
 
296 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  45.63 
 
 
295 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  30.96 
 
 
303 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  45.63 
 
 
295 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  45.63 
 
 
295 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  30.47 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  36.92 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  30.67 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2405  parB-like partition protein  29.73 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  26.25 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2731  parB-like partition protein  30.36 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2788  parB-like partition protein  30.36 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>