39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3847 on replicon NC_009956
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009956  Dshi_3847  nuclease  100 
 
 		 374 aa  752    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.298073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2912  replication protein, putative  66.58 
 
 		 369 aa  478  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.595815  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7211  RepB partitioning protein/ParB-like protein  38.22 
 
 		 350 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4321  hypothetical protein  38.27 
 
 		 350 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.185891 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4243  hypothetical protein  36.79 
 
 		 352 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.444591 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3405  ParB-like nuclease  33.82 
 
 		 360 aa  106  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3691  hypothetical protein  37.45 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7084  ParB-like nuclease  36.62 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.403712  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4212  nuclease  33.85 
 
 		 367 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.789565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4083  nuclease  36.1 
 
 		 368 aa  96.3  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.214085 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3774  ParB-like nuclease  31.15 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.142601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1422  ParB-like nuclease  35.32 
 
 		 361 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4264  ParB-like nuclease  35.47 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.373587 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3492  nuclease  35.32 
 
 		 361 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0639009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3856  nuclease  33.5 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.465439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0372  ParB-like nuclease  35.5 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  31.69 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  35.04 
 
 		 336 aa  52.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  27.27 
 
 		 347 aa  49.7  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  28.11 
 
 		 274 aa  49.7  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3820  parB-like partition proteins  35.19 
 
 		 564 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.621795  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  32.39 
 
 		 340 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  25.59 
 
 		 322 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  31.29 
 
 		 322 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3193  parB-like partition proteins  43.75 
 
 		 597 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2588  ParB family protein  30.06 
 
 		 447 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  34.15 
 
 		 392 aa  46.6  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  38.89 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2411  ParB domain protein nuclease  39.06 
 
 		 284 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000114974  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  36.75 
 
 		 268 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  30.86 
 
 		 272 aa  44.3  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2422  parB-like partition protein  32.41 
 
 		 285 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568139 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6062  plasmid partitioning protein ParB  40.32 
 
 		 369 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  34.65 
 
 		 312 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  42.03 
 
 		 290 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  27.87 
 
 		 326 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0782  ParB domain protein nuclease  31.03 
 
 		 171 aa  43.5  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2275  parB-like partition proteins  48.72 
 
 		 605 aa  42.7  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.174874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  51.16 
 
 		 529 aa  42.7  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>