45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4321 on replicon NC_009431
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007489  RSP_7211  RepB partitioning protein/ParB-like protein  96.29 
 
 		 350 aa  665    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4321  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  690    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.185891 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3847  nuclease  38.27 
 
 		 374 aa  182  7e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.298073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2912  replication protein, putative  34.9 
 
 		 369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.595815  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7084  ParB-like nuclease  46.23 
 
 		 371 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.403712  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4083  nuclease  45.96 
 
 		 368 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.214085 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4243  hypothetical protein  39.69 
 
 		 352 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.444591 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3492  nuclease  43.53 
 
 		 361 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0639009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1422  ParB-like nuclease  44.95 
 
 		 361 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3691  hypothetical protein  42.93 
 
 		 361 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3774  ParB-like nuclease  36.3 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.142601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3856  nuclease  39.71 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.465439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4212  nuclease  37.74 
 
 		 367 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.789565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3405  ParB-like nuclease  33.33 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4264  ParB-like nuclease  36.27 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.373587 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0372  ParB-like nuclease  32.57 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  31.91 
 
 		 322 aa  54.3  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6163  plasmid partitioning protein RepB  34.93 
 
 		 332 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  35.46 
 
 		 336 aa  53.5  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  32.62 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  37.14 
 
 		 274 aa  50.4  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  27.1 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4710  parB-like partition protein  29.31 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  33.8 
 
 		 360 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  37.68 
 
 		 332 aa  47.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  39.32 
 
 		 342 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  35.29 
 
 		 347 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  34.23 
 
 		 294 aa  46.6  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  34.23 
 
 		 294 aa  46.6  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  30.99 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 325 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  32.54 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  38.54 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  39.18 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  30.36 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  32 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  36.92 
 
 		 298 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  36.92 
 
 		 298 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3820  parB-like partition proteins  29.91 
 
 		 564 aa  43.5  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.621795  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  35.38 
 
 		 298 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  36.67 
 
 		 333 aa  43.1  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  32.31 
 
 		 326 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  35.96 
 
 		 293 aa  42.7  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4293  parB-like partition proteins  27.61 
 
 		 583 aa  42.7  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.407896 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2897  parB-like partition protein  27.39 
 
 		 314 aa  42.7  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.024041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>