More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6163 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6163  plasmid partitioning protein RepB  100 
 
 
332 aa  675    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331476  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4710  parB-like partition protein  54.41 
 
 
335 aa  353  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  37.01 
 
 
332 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  34.51 
 
 
329 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  36.65 
 
 
315 aa  162  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  33.97 
 
 
336 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  36.14 
 
 
342 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  34.03 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4572  parB-like partition proteins  33.95 
 
 
343 aa  145  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  35.51 
 
 
333 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  33.7 
 
 
358 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  34.77 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  37.68 
 
 
336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  34.63 
 
 
331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29862 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  33.21 
 
 
335 aa  139  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  34.84 
 
 
331 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  33.33 
 
 
349 aa  136  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  32.62 
 
 
351 aa  135  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  30.62 
 
 
347 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  34.77 
 
 
348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  37.06 
 
 
333 aa  133  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  30.51 
 
 
316 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  28.28 
 
 
333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9002  replication protein B  32.91 
 
 
325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  40.45 
 
 
335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  31.01 
 
 
334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  32.75 
 
 
325 aa  129  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4533  parB-like partition protein  30.92 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  30.18 
 
 
347 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  34.72 
 
 
340 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  38.89 
 
 
339 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  32.79 
 
 
360 aa  125  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  36.26 
 
 
322 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  31.83 
 
 
347 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  32.98 
 
 
336 aa  122  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  36.87 
 
 
337 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8200  replication protein B  31.38 
 
 
345 aa  119  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  33.33 
 
 
328 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  31.63 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  31.63 
 
 
328 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  31.27 
 
 
328 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  36.72 
 
 
350 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  33.21 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  29.62 
 
 
326 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  30.69 
 
 
353 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  30.13 
 
 
331 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  32.52 
 
 
322 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  38.41 
 
 
274 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  27.33 
 
 
334 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  30.81 
 
 
345 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  30.68 
 
 
338 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  31.66 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  28.09 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  28.95 
 
 
299 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  31.58 
 
 
274 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  30.05 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  30.91 
 
 
287 aa  63.9  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  28.09 
 
 
293 aa  63.5  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  28.76 
 
 
294 aa  63.5  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  28.09 
 
 
293 aa  63.5  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  31.41 
 
 
268 aa  63.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  29.51 
 
 
286 aa  63.2  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  30.99 
 
 
290 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  30.99 
 
 
290 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  30.41 
 
 
290 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  33.54 
 
 
261 aa  62.8  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  29.67 
 
 
295 aa  62.8  0.000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  30.17 
 
 
319 aa  62.4  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  27.49 
 
 
289 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  32.72 
 
 
315 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  31.45 
 
 
298 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2927  parB-like partition protein  31.72 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  33.71 
 
 
297 aa  60.8  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  32.89 
 
 
323 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  32.02 
 
 
292 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  32.02 
 
 
292 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  34.72 
 
 
295 aa  60.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  32.02 
 
 
292 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  29.24 
 
 
290 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  30 
 
 
293 aa  60.1  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  29.3 
 
 
298 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  31.61 
 
 
306 aa  59.7  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  30 
 
 
296 aa  59.7  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  31.14 
 
 
306 aa  59.3  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  29.67 
 
 
285 aa  59.3  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  31.76 
 
 
334 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  33.54 
 
 
292 aa  58.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  34.09 
 
 
307 aa  58.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  33.55 
 
 
285 aa  58.9  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  31.65 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  32.9 
 
 
304 aa  58.9  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  30.77 
 
 
321 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  28.87 
 
 
367 aa  58.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  32.65 
 
 
331 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  31.43 
 
 
391 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3097  ParB family protein  28.98 
 
 
668 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650807  decreased coverage  0.0000165149 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  31.65 
 
 
298 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  31.65 
 
 
298 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  27.12 
 
 
256 aa  57.8  0.0000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  33.11 
 
 
341 aa  57.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>