285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9502 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  100 
 
 		 332 aa  669    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  56 
 
 		 329 aa  358  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  56.44 
 
 		 329 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  47.99 
 
 		 336 aa  276  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  46.31 
 
 		 351 aa  239  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  42.18 
 
 		 347 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  40.54 
 
 		 335 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  45.54 
 
 		 349 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  52.81 
 
 		 358 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  43.82 
 
 		 360 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  38.6 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  42.62 
 
 		 333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  38.79 
 
 		 331 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29862 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  40.53 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  39.04 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  40.66 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  41.25 
 
 		 348 aa  206  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  36.14 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  40.46 
 
 		 336 aa  202  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  40.3 
 
 		 333 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  39.54 
 
 		 334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  38.49 
 
 		 333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  39.3 
 
 		 322 aa  195  9e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  39.55 
 
 		 339 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  50 
 
 		 353 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  37.23 
 
 		 350 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  40.43 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  36.97 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  36.55 
 
 		 335 aa  187  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  33.64 
 
 		 328 aa  186  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  34.24 
 
 		 328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4572  parB-like partition proteins  38.28 
 
 		 343 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  36.93 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  34.24 
 
 		 328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  36.57 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  36.96 
 
 		 325 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  42.54 
 
 		 347 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6163  plasmid partitioning protein RepB  37.01 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  33.84 
 
 		 326 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  45.19 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  36.79 
 
 		 312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9002  replication protein B  42.22 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  35.25 
 
 		 345 aa  155  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8200  replication protein B  32.35 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4533  parB-like partition protein  33.43 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  31.08 
 
 		 331 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4710  parB-like partition protein  35.09 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  34.53 
 
 		 334 aa  149  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  33.44 
 
 		 328 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  31.44 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  40.14 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4176  parB-like partition protein  36.88 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  33.33 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  34.48 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  34.42 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  34.31 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  30.23 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  30.23 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  30.23 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  30.23 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  30.23 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  30.23 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  25.31 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  30.23 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  30.23 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  34.68 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  34.68 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2275  parB-like partition proteins  34.67 
 
 		 605 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.174874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  30.23 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  30.23 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0068  DNA-binding protein  24.9 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  35.77 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  33.86 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  29.77 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  25.6 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  29.3 
 
 		 295 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  32.73 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  33.59 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  25.2 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  25.2 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  25.2 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5196  ParB family protein  40.45 
 
 		 549 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.791015 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  25.2 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  25.2 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  25.6 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  25.2 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  32.24 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  25.2 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  25.2 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  29.53 
 
 		 345 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  30.23 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  34.19 
 
 		 341 aa  57  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0003  hypothetical protein  23.77 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  39.84 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3888  parB-like partition protein  30.04 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  26.2 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  35.07 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  33.07 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  30.23 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  39.13 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>