295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4176 on replicon NC_008738
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008738  Maqu_4176  parB-like partition protein  100 
 
 
360 aa  724    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  26.28 
 
 
334 aa  84  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0068  DNA-binding protein  25.91 
 
 
334 aa  82.4  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  29.39 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0003  hypothetical protein  26.14 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  36.88 
 
 
332 aa  72.8  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  33.53 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3917  parB-like partition protein  30.3 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0077  ParB family protein  26.81 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  hitchhiker  0.00493853 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  37.96 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  34.25 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  27.49 
 
 
329 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  35.34 
 
 
279 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  33.97 
 
 
345 aa  64.7  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2731  parB-like partition protein  30.68 
 
 
279 aa  63.9  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  25.19 
 
 
322 aa  63.9  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2788  parB-like partition protein  30.68 
 
 
279 aa  63.9  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  34.36 
 
 
299 aa  63.5  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  27.34 
 
 
349 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  31.49 
 
 
329 aa  63.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  34.01 
 
 
326 aa  63.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  33.14 
 
 
336 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4954  parB-like partition protein  28.42 
 
 
324 aa  62.8  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  32.12 
 
 
331 aa  62.8  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1586  parB-like partition protein  36.07 
 
 
300 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  0.0130059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1865  parB-like partition protein  36.07 
 
 
298 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0917667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1653  parB-like partition protein  36.07 
 
 
300 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.854391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  32.6 
 
 
351 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  30.13 
 
 
333 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  30.22 
 
 
347 aa  62.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  30.41 
 
 
335 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  31.82 
 
 
315 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  32.88 
 
 
290 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  32.88 
 
 
290 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  34.53 
 
 
347 aa  62  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  31.51 
 
 
290 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  31.68 
 
 
358 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  31.5 
 
 
333 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  32.12 
 
 
348 aa  62  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  32.06 
 
 
336 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  37.98 
 
 
281 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  32.05 
 
 
292 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  32.88 
 
 
290 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  32.88 
 
 
290 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  32.88 
 
 
290 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  32.88 
 
 
290 aa  60.8  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  32.88 
 
 
290 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  32.88 
 
 
290 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  32.88 
 
 
290 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4692  parB-like partition proteins  28.36 
 
 
337 aa  60.1  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0209451  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  26.81 
 
 
335 aa  60.5  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  31.76 
 
 
301 aa  60.1  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  33.11 
 
 
353 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  31.76 
 
 
296 aa  60.1  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  35.11 
 
 
333 aa  59.7  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  31.76 
 
 
300 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  35.11 
 
 
333 aa  59.7  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  32.47 
 
 
339 aa  59.7  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  34.62 
 
 
295 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  34.62 
 
 
295 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  34.62 
 
 
295 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  34.62 
 
 
295 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  34.62 
 
 
295 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  34.62 
 
 
295 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  29.81 
 
 
312 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  34.62 
 
 
295 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  34.36 
 
 
303 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  28.57 
 
 
316 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  27.55 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  33.86 
 
 
293 aa  58.5  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  33.33 
 
 
331 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  32.93 
 
 
293 aa  57.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  33.97 
 
 
295 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  34.13 
 
 
280 aa  57.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  34.39 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  26.18 
 
 
345 aa  57.4  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  27.62 
 
 
362 aa  57  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  35.97 
 
 
305 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  35.97 
 
 
305 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  35.83 
 
 
306 aa  57  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  35.97 
 
 
297 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  35.97 
 
 
297 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  31.29 
 
 
337 aa  56.6  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  30.83 
 
 
328 aa  56.2  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  31.76 
 
 
293 aa  55.8  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  33.07 
 
 
340 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  31.76 
 
 
293 aa  55.8  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  32.06 
 
 
278 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  33.12 
 
 
303 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  33.97 
 
 
295 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  30 
 
 
297 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6576  parB-like partition protein  33.56 
 
 
324 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152198  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  33.33 
 
 
322 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2405  parB-like partition protein  34.17 
 
 
268 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  27.9 
 
 
342 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  30.83 
 
 
328 aa  54.7  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 
295 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  26.85 
 
 
334 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  33.58 
 
 
255 aa  54.7  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  32.54 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>