More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9801 on replicon NC_011986
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  100 
 
 		 345 aa  693    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  53.37 
 
 		 350 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  48.01 
 
 		 347 aa  298  7e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  42.82 
 
 		 322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  40.8 
 
 		 328 aa  242  6e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  40.8 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  39.94 
 
 		 326 aa  232  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  39.42 
 
 		 328 aa  229  7e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  40.06 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  39.59 
 
 		 333 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  38.79 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  39.37 
 
 		 331 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29862 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  37.32 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  36.52 
 
 		 335 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  35.69 
 
 		 347 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  39.66 
 
 		 331 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  39.35 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  35.86 
 
 		 347 aa  199  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  40.13 
 
 		 351 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  46.75 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  37.42 
 
 		 331 aa  193  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  38.26 
 
 		 349 aa  192  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  36.11 
 
 		 329 aa  186  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  36.17 
 
 		 339 aa  182  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  34.97 
 
 		 329 aa  178  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  34.71 
 
 		 358 aa  176  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  35.28 
 
 		 348 aa  176  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9002  replication protein B  33.92 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  40.82 
 
 		 336 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  35.71 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  33.91 
 
 		 335 aa  169  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  32.75 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  39 
 
 		 337 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  31.9 
 
 		 334 aa  162  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  34.51 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  35.07 
 
 		 360 aa  159  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  34.27 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  38.13 
 
 		 353 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  31.23 
 
 		 325 aa  155  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  39.48 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  35.12 
 
 		 336 aa  146  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4572  parB-like partition proteins  34.09 
 
 		 343 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4533  parB-like partition protein  34.01 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  38.6 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4710  parB-like partition protein  28.82 
 
 		 335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  38.39 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8200  replication protein B  33.93 
 
 		 345 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6163  plasmid partitioning protein RepB  30.81 
 
 		 332 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  32.14 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  33.14 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  35.88 
 
 		 328 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  34.76 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4692  parB-like partition proteins  38.06 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0209451  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  28.82 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  47.12 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  30 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  31.54 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  34.67 
 
 		 319 aa  65.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  26.59 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  31.82 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4176  parB-like partition protein  33.97 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3888  parB-like partition protein  34.46 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  27.03 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  29.87 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  31.85 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  32.61 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  29.05 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  33.08 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  27.31 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  35.24 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  26.8 
 
 		 290 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1123  parB-like partition protein  39.52 
 
 		 572 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  31.38 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  32.06 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  32.06 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  32.06 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  32.06 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  32.06 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  34.09 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  32.06 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  32.06 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  30.66 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  24.56 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  24.56 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  33.58 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  33.1 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3738  parB-like partition proteins  30.88 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.412058 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  31.82 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  31.82 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  32.06 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  32.06 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  30.68 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  27.84 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  27.27 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  28.24 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  34.56 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  29.35 
 
 		 290 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  29.89 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  29.51 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1319  chromosome segregation DNA-binding protein  34.48 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>