288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7788 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  100 
 
 		 347 aa  681    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  50.89 
 
 		 331 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  51.65 
 
 		 331 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29862 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  45.54 
 
 		 335 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  50.17 
 
 		 351 aa  249  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  44.79 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  49.01 
 
 		 349 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  44.59 
 
 		 329 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  43.24 
 
 		 332 aa  245  9e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  43.71 
 
 		 329 aa  242  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  42.73 
 
 		 336 aa  239  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  45.43 
 
 		 336 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  47 
 
 		 348 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  45.05 
 
 		 333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  41.81 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  41.57 
 
 		 333 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  44.01 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  42.86 
 
 		 350 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  44.6 
 
 		 333 aa  225  8e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  41.27 
 
 		 333 aa  225  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  44.64 
 
 		 340 aa  218  8.999999999999998e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9002  replication protein B  41.61 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  43.61 
 
 		 337 aa  213  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  39.55 
 
 		 347 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  42.47 
 
 		 358 aa  210  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  43.75 
 
 		 360 aa  208  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  42.7 
 
 		 347 aa  208  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  42.32 
 
 		 322 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  44.7 
 
 		 334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  38.98 
 
 		 325 aa  199  7.999999999999999e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  43.28 
 
 		 336 aa  197  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  46.84 
 
 		 353 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  39.1 
 
 		 342 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  39.49 
 
 		 345 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  42.91 
 
 		 322 aa  192  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  39.15 
 
 		 326 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  39.56 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4572  parB-like partition proteins  41.82 
 
 		 343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  34.42 
 
 		 328 aa  190  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  39.56 
 
 		 328 aa  189  7e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  39.43 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8200  replication protein B  34.43 
 
 		 345 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  36.7 
 
 		 312 aa  166  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  32.23 
 
 		 331 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4710  parB-like partition protein  33.99 
 
 		 335 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  33.54 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4533  parB-like partition protein  31.55 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6163  plasmid partitioning protein RepB  30.94 
 
 		 332 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  33.76 
 
 		 328 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  35.91 
 
 		 274 aa  106  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  39.33 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4692  parB-like partition proteins  30.69 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0209451  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4176  parB-like partition protein  37.96 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  34.4 
 
 		 292 aa  67  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  46.07 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  28.94 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  32.64 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  31.05 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  36.13 
 
 		 296 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  32.52 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0077  ParB family protein  31.53 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  hitchhiker  0.00493853 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  36.84 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  36.84 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3097  ParB family protein  30.61 
 
 		 668 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650807  decreased coverage  0.0000165149 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  41.94 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  32.89 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  33.06 
 
 		 300 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  32.8 
 
 		 299 aa  57  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  44.83 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  30.87 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  28.11 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  30.46 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  36.94 
 
 		 319 aa  55.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2849  chromosome segregation DNA-binding protein  36.52 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573322  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  34.13 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2880  parB-like partition protein  35.65 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4390  parB-like partition protein  32.64 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297603  normal  0.71215 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5053  ParB family protein  47.37 
 
 		 582 aa  54.3  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4308  parB-like partition protein  34.94 
 
 		 607 aa  53.9  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  33.53 
 
 		 290 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  33.61 
 
 		 294 aa  53.5  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  43.16 
 
 		 303 aa  53.5  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  32.76 
 
 		 305 aa  53.5  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  35.51 
 
 		 294 aa  53.1  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  32.35 
 
 		 290 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  32.35 
 
 		 290 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  32.35 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  40.74 
 
 		 283 aa  52.4  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1422  ParB-like nuclease  35.42 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  40.74 
 
 		 281 aa  52.8  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3492  nuclease  35.42 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0639009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  24.21 
 
 		 334 aa  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  28.65 
 
 		 315 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  32.46 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2275  parB-like partition proteins  41.46 
 
 		 605 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.174874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  32.52 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0047  transcriptional repressor  27.54 
 
 		 359 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  23.53 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1762  parB-like partition protein  41.75 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3691  hypothetical protein  33.85 
 
 		 361 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.364785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>