More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4688 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  100 
 
 		 322 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  49.71 
 
 		 350 aa  295  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  49.07 
 
 		 328 aa  285  8e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  49.07 
 
 		 328 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  47.19 
 
 		 326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  48.05 
 
 		 328 aa  278  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  46.33 
 
 		 347 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  45 
 
 		 312 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  42.52 
 
 		 345 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  42.09 
 
 		 335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  39.32 
 
 		 331 aa  229  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  40 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  45.27 
 
 		 336 aa  226  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  40.47 
 
 		 347 aa  225  8e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  40.18 
 
 		 331 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29862 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  39.7 
 
 		 333 aa  219  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  39.94 
 
 		 333 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  42.14 
 
 		 339 aa  218  8.999999999999998e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  38.21 
 
 		 333 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  40.41 
 
 		 333 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  41.98 
 
 		 347 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  38.82 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  42.52 
 
 		 351 aa  202  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  37.94 
 
 		 329 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  39.06 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  41.58 
 
 		 349 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  40.68 
 
 		 322 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  37.5 
 
 		 329 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  37.06 
 
 		 325 aa  192  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  42.86 
 
 		 358 aa  189  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  38.87 
 
 		 348 aa  189  5.999999999999999e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  34.78 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9002  replication protein B  36.17 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  36.57 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  36.27 
 
 		 315 aa  185  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  35.26 
 
 		 340 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  42.11 
 
 		 360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  35.49 
 
 		 316 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 334 aa  162  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  42.15 
 
 		 342 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  35.84 
 
 		 334 aa  159  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  37 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4572  parB-like partition proteins  37.03 
 
 		 343 aa  155  9e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4710  parB-like partition protein  33.45 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4533  parB-like partition protein  31.67 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  42.27 
 
 		 353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8200  replication protein B  33.22 
 
 		 345 aa  145  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  32.35 
 
 		 328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  39.69 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6163  plasmid partitioning protein RepB  32.52 
 
 		 332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  41.5 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  33.7 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  33.12 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4692  parB-like partition proteins  30.11 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0209451  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 362 aa  65.9  0.0000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  32.2 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5942  parB-like partition protein  32.34 
 
 		 295 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4176  parB-like partition protein  29.17 
 
 		 360 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  30.06 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0037  transcription repressor protein KorB  32.39 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.871786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  30.67 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  29.84 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  28.16 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  31.94 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  31.94 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4308  parB-like partition protein  40.79 
 
 		 607 aa  59.7  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  27.14 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  30.39 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  34.56 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  29.65 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  31.69 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  26.86 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  32 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  29.49 
 
 		 529 aa  58.9  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  31.54 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  32.62 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  29.76 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3888  parB-like partition protein  34.85 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3744  RC101  30 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.803465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  28.65 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0068  DNA-binding protein  26.63 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  29.41 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  29.41 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  29.41 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4698  parB-like partition proteins  36.8 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  28.57 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  28.67 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  28.96 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1586  parB-like partition protein  36.44 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  0.0130059 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  31.39 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1653  parB-like partition protein  36.44 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.854391 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2880  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  31.39 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  31.39 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1865  parB-like partition protein  36.44 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0917667 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  31.39 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2927  parB-like partition protein  32.5 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4264  ParB-like nuclease  32 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.373587 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  31.39 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4390  parB-like partition protein  35.29 
 
 		 336 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297603  normal  0.71215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>