More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6500 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  100 
 
 		 350 aa  705    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  53.37 
 
 		 345 aa  329  5.0000000000000004e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  51.3 
 
 		 347 aa  324  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  49.71 
 
 		 322 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  45.29 
 
 		 326 aa  269  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  44.06 
 
 		 328 aa  265  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  44.61 
 
 		 328 aa  264  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  44.06 
 
 		 328 aa  263  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  43.64 
 
 		 333 aa  261  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  41.52 
 
 		 333 aa  257  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  43.24 
 
 		 331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  44.12 
 
 		 331 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29862 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  37.89 
 
 		 335 aa  245  6e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  43.85 
 
 		 339 aa  242  7e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  45.19 
 
 		 351 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  41.72 
 
 		 312 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  39.77 
 
 		 347 aa  232  8.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  44.74 
 
 		 349 aa  229  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9002  replication protein B  38.86 
 
 		 325 aa  226  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  38.26 
 
 		 347 aa  225  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  40.38 
 
 		 329 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  36.76 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  42.16 
 
 		 322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  39.25 
 
 		 331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  36.76 
 
 		 333 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  40.79 
 
 		 335 aa  212  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  39.48 
 
 		 329 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  35.07 
 
 		 336 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  36 
 
 		 316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  34.64 
 
 		 348 aa  199  6e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  37.23 
 
 		 332 aa  199  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  39.22 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  38.62 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  38.59 
 
 		 336 aa  193  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  37.77 
 
 		 337 aa  183  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  36.33 
 
 		 315 aa  179  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  36.71 
 
 		 360 aa  172  7.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  36.9 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  35.33 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 325 aa  169  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  37.27 
 
 		 336 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  45.37 
 
 		 353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4710  parB-like partition protein  34.01 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4533  parB-like partition protein  34.67 
 
 		 326 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  31.62 
 
 		 334 aa  146  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4572  parB-like partition proteins  34.16 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8200  replication protein B  35.41 
 
 		 345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6163  plasmid partitioning protein RepB  36.72 
 
 		 332 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  40.96 
 
 		 338 aa  109  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  40.72 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  37.32 
 
 		 274 aa  86.3  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4692  parB-like partition proteins  32.44 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0209451  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  36 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4176  parB-like partition protein  29.39 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  36 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  33.1 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3888  parB-like partition protein  33.92 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  41.74 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  30.38 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  25.69 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  30.89 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  29.35 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  33.82 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  33.82 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0068  DNA-binding protein  29.75 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  28.02 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  33.81 
 
 		 300 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  33.08 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  29.17 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  29.9 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  29.9 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  29.9 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  35.76 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  31.41 
 
 		 292 aa  59.3  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3744  RC101  35.33 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.803465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4308  parB-like partition protein  37.5 
 
 		 607 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  36.04 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  30.82 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  28.57 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  28.93 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  32.17 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  32.17 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  32.17 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  32.17 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  31.75 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  25.41 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0003  hypothetical protein  28.15 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  35.1 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  31.16 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  35.1 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  32.17 
 
 		 290 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  32.17 
 
 		 290 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  31.62 
 
 		 305 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  32.17 
 
 		 290 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  32.17 
 
 		 290 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  32.17 
 
 		 290 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0077  ParB family protein  29.33 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  hitchhiker  0.00493853 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  32.8 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  28.49 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  33.06 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>