203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0003 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006365  plpp0003  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  690    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  62.83 
 
 		 334 aa  429  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0068  DNA-binding protein  62.54 
 
 		 334 aa  426  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  27.94 
 
 		 359 aa  89.4  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  29.75 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3917  parB-like partition protein  31.38 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4692  parB-like partition proteins  28.66 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0209451  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  27.68 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  26.82 
 
 		 348 aa  75.9  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5036  parB-like partition proteins  28.7 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5336  parB-like partition protein  29.47 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.557995 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4176  parB-like partition protein  26.14 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4954  parB-like partition protein  28.22 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  30.67 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  21.32 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0077  ParB family protein  25.95 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  hitchhiker  0.00493853 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  27.51 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  24.43 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4951  hypothetical protein  24.12 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  25.91 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  28.07 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  23.08 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  23.43 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  24.24 
 
 		 333 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4533  parB-like partition protein  29.66 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  28.15 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2422  parB-like partition protein  22.74 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3503  parB-like partition protein  27.62 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.576785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  31.25 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  30.47 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  26.97 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  23.85 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2821  parB-like partition protein  30.77 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  32.24 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  32.24 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  30.1 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  23.77 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  23.43 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  32.85 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  29.92 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  23.91 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2543  parB-like partition protein  29.91 
 
 		 358 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.0207882 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  25.93 
 
 		 333 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  31.61 
 
 		 293 aa  53.9  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  25.61 
 
 		 333 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  29.89 
 
 		 296 aa  53.1  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  26.33 
 
 		 296 aa  52.8  0.000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  23.2 
 
 		 360 aa  52.8  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  24.39 
 
 		 335 aa  52.8  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  23.79 
 
 		 351 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  30.43 
 
 		 347 aa  52.8  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  25.27 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  26.98 
 
 		 334 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  30.28 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  29.75 
 
 		 529 aa  52  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  27.78 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  29.68 
 
 		 285 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  30.47 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  29.13 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  32.59 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  31.43 
 
 		 304 aa  50.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  25.27 
 
 		 358 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  27.74 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  32.59 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  27.89 
 
 		 347 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  32.14 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  29.29 
 
 		 335 aa  50.8  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  27.16 
 
 		 290 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  27.16 
 
 		 290 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  31.62 
 
 		 302 aa  50.1  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  32.09 
 
 		 296 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  28.75 
 
 		 290 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  28.75 
 
 		 290 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  30.32 
 
 		 280 aa  49.7  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3590  parB-like partition protein  27.22 
 
 		 361 aa  49.7  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  32.31 
 
 		 422 aa  49.3  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  30.67 
 
 		 290 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  27.42 
 
 		 353 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  29.27 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  30.67 
 
 		 290 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  30 
 
 		 268 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1331  parB-like partition protein  28.57 
 
 		 269 aa  49.3  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000205229 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  29.49 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  28.12 
 
 		 290 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  28.12 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  28.12 
 
 		 290 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  27.89 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  30.95 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  32.48 
 
 		 281 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  30.4 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  27.27 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  28.42 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  28.12 
 
 		 290 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  28.12 
 
 		 290 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  28.12 
 
 		 290 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  28.12 
 
 		 290 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  31.39 
 
 		 310 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  31.75 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  27.92 
 
 		 292 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4936  parB-like partition protein  26.82 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153012  normal  0.946011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>