276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3917 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3917  parB-like partition protein  100 
 
 		 327 aa  661    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4954  parB-like partition protein  70.68 
 
 		 324 aa  480  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5336  parB-like partition protein  37.5 
 
 		 343 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.557995 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3590  parB-like partition protein  40.47 
 
 		 361 aa  211  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4951  hypothetical protein  41.43 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5036  parB-like partition proteins  42.8 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3503  parB-like partition protein  41.71 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.576785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  27.06 
 
 		 334 aa  87.8  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0068  DNA-binding protein  27.06 
 
 		 334 aa  87.8  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0003  hypothetical protein  31.38 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  30.89 
 
 		 359 aa  79.3  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4251  plasmid-partitioning protein  29.55 
 
 		 322 aa  75.9  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0980763 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  30.99 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  33.12 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  32.86 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4176  parB-like partition protein  30.3 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0077  ParB family protein  24.01 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  hitchhiker  0.00493853 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  30.68 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  34.59 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  31.62 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  27.76 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  33.56 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  29.27 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0006  plasmid-partitioning protein  29.12 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  35.9 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  37.07 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  26.57 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  35.9 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  35.65 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  33.79 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  33.62 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0021  plasmid-partitioning protein  28.57 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.155316  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  29.82 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0046  plasmid-partitioning protein  28.57 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.047127  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  31.52 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  31.52 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  31.52 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  31.52 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0072  plasmid-partitioning protein  28.57 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000633113 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  32.41 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  34.21 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  32.41 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  32.41 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  31.52 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1025  parB-like partition protein  35.09 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  29.82 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  32.41 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  32.41 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  32.76 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  31.37 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  37 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  28.37 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  27.14 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  32.46 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  32.17 
 
 		 296 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  27.44 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2731  parB-like partition protein  31.58 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  31.72 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0105  effector of nucleoid occlusion Noc  28.38 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000144978  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  37 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1653  parB-like partition protein  31.78 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.854391 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2788  parB-like partition protein  31.58 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0008  ParB family partitioning protein  30.73 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1865  parB-like partition protein  31.78 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0917667 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  34.26 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  34.26 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1586  parB-like partition protein  31.78 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  0.0130059 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  33.33 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  35.96 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  34.21 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6062  plasmid partitioning protein ParB  33.04 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  27.74 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  34.21 
 
 		 269 aa  57  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  28.32 
 
 		 284 aa  57  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04091  ParB family protein  29.66 
 
 		 292 aa  57  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00869743  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0008  plasmid-partitioning protein  28.39 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.188709 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  30.06 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  32.79 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  31.58 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  27.86 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  28.17 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  29.03 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  25.47 
 
 		 281 aa  55.5  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  24.68 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  31.03 
 
 		 294 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  32.08 
 
 		 288 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1837  parB-like partition protein  26.67 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  30.34 
 
 		 290 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  27.94 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  29.73 
 
 		 422 aa  54.7  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  34.21 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  26.67 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  25.35 
 
 		 314 aa  54.3  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  28.22 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  25.7 
 
 		 274 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  24.27 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  29.75 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  30.49 
 
 		 338 aa  54.3  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  26.5 
 
 		 292 aa  53.9  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>