177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5376 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  100 
 
 		 349 aa  669    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  78.03 
 
 		 351 aa  479  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  51.31 
 
 		 335 aa  311  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  48.06 
 
 		 333 aa  278  7e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  49.84 
 
 		 336 aa  260  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  43.25 
 
 		 335 aa  250  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  44.31 
 
 		 339 aa  248  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  45.33 
 
 		 333 aa  245  9e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  45.71 
 
 		 347 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  44.82 
 
 		 333 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  45.77 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  42.48 
 
 		 315 aa  232  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  45.54 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  38.81 
 
 		 347 aa  230  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  43.62 
 
 		 337 aa  229  6e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  40.12 
 
 		 331 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  47.19 
 
 		 334 aa  229  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  44.17 
 
 		 336 aa  225  8e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  39.24 
 
 		 331 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29862 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  41.39 
 
 		 329 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  44.04 
 
 		 348 aa  223  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  39.65 
 
 		 329 aa  222  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  40.79 
 
 		 347 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  42.52 
 
 		 350 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  49.16 
 
 		 353 aa  216  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  44.16 
 
 		 340 aa  215  8e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9002  replication protein B  38.75 
 
 		 325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  41.25 
 
 		 322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  40.65 
 
 		 358 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  40.2 
 
 		 325 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  41.78 
 
 		 360 aa  209  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4572  parB-like partition proteins  44.04 
 
 		 343 aa  206  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  37.32 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  42.19 
 
 		 342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  40.76 
 
 		 322 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  38.29 
 
 		 328 aa  192  5e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  38.29 
 
 		 328 aa  192  8e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  38.33 
 
 		 328 aa  192  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  37.38 
 
 		 326 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  36.73 
 
 		 345 aa  186  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  36.75 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  38.11 
 
 		 312 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  39.38 
 
 		 331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4533  parB-like partition protein  37.73 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  34.15 
 
 		 334 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8200  replication protein B  31.79 
 
 		 345 aa  142  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6163  plasmid partitioning protein RepB  33.33 
 
 		 332 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4710  parB-like partition protein  27.82 
 
 		 335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  38.59 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  39.89 
 
 		 338 aa  106  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  33.7 
 
 		 274 aa  105  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  30.6 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  36.89 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  37.82 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4176  parB-like partition protein  27.34 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  29.1 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4308  parB-like partition protein  41.1 
 
 		 607 aa  59.3  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0047  transcriptional repressor  30.25 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0039  parB-like partition protein  30.25 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.103386  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  37.39 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  36.7 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  32.31 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3097  ParB family protein  32.17 
 
 		 668 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650807  decreased coverage  0.0000165149 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  29.67 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0077  ParB family protein  27.8 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  hitchhiker  0.00493853 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0003  hypothetical protein  23.43 
 
 		 335 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  31.21 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  25.97 
 
 		 334 aa  54.7  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  31.06 
 
 		 305 aa  53.5  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1123  parB-like partition protein  40.24 
 
 		 572 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0068  DNA-binding protein  25.32 
 
 		 334 aa  53.1  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  32.52 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  27.6 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6444  ParB family protein  37.23 
 
 		 349 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6603  parB-like partition proteins  37.23 
 
 		 349 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  26.38 
 
 		 290 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  26.38 
 
 		 290 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2476  parB-like partition proteins  40.74 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.751865  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4306  ParB family protein  38.54 
 
 		 355 aa  50.4  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5196  ParB family protein  37.93 
 
 		 549 aa  50.4  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.791015 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0037  transcription repressor protein KorB  28.67 
 
 		 350 aa  50.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.871786  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  34.17 
 
 		 292 aa  50.1  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  33.54 
 
 		 330 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  33.54 
 
 		 330 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  33.54 
 
 		 330 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  31.21 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4243  hypothetical protein  30.77 
 
 		 352 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.444591 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  25.27 
 
 		 305 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  32.06 
 
 		 392 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  32.34 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  29.37 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4692  parB-like partition proteins  26.55 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0209451  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  25.98 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  30.82 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3503  parB-like partition protein  32.73 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.576785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  32.28 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3774  ParB-like nuclease  32.62 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.142601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  31.45 
 
 		 296 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>