24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3856 on replicon NC_009956
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009956  Dshi_3856  nuclease  100 
 
 		 391 aa  761    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.465439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3774  ParB-like nuclease  41.1 
 
 		 376 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.142601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4243  hypothetical protein  46.35 
 
 		 352 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.444591 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7084  ParB-like nuclease  52.99 
 
 		 371 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.403712  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4083  nuclease  53.23 
 
 		 368 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.214085 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1422  ParB-like nuclease  45.29 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3492  nuclease  45.29 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0639009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3691  hypothetical protein  44 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3405  ParB-like nuclease  35.96 
 
 		 360 aa  171  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4264  ParB-like nuclease  37.11 
 
 		 321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.373587 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4212  nuclease  39.43 
 
 		 367 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.789565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4321  hypothetical protein  36.6 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.185891 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7211  RepB partitioning protein/ParB-like protein  37.34 
 
 		 350 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0372  ParB-like nuclease  37.97 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2912  replication protein, putative  33.19 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.595815  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3847  nuclease  32.14 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.298073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  27.89 
 
 		 335 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  28.44 
 
 		 333 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  31.21 
 
 		 333 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  31.21 
 
 		 333 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  34.21 
 
 		 322 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  29.15 
 
 		 337 aa  43.1  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  29.41 
 
 		 340 aa  43.1  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  33.09 
 
 		 349 aa  43.1  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>