32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4454 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4454  hypothetical protein  100 
 
 		 575 aa  1165    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59070  hypothetical protein  90.12 
 
 		 579 aa  1039    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000160429  normal  0.0321205 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1527  hypothetical protein  50.6 
 
 		 586 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.521319  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0478  hypothetical protein  45.88 
 
 		 574 aa  437  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1664  hypothetical protein  45.2 
 
 		 574 aa  433  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0565  hypothetical protein  44.5 
 
 		 541 aa  426  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2815  hypothetical protein  44.5 
 
 		 573 aa  421  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1451  hypothetical protein  44.46 
 
 		 551 aa  419  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0997  hypothetical protein  44.86 
 
 		 552 aa  411  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1229  hypothetical protein  43.95 
 
 		 550 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445379 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2292  hypothetical protein  44.62 
 
 		 559 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0363731  hitchhiker  0.000163049 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1317  hypothetical protein  43.56 
 
 		 559 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.195654  normal  0.119576 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0638  hypothetical protein  46.71 
 
 		 559 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.0615794 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3379  hypothetical protein  43.66 
 
 		 554 aa  398  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60985  normal  0.431334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4144  hypothetical protein  42.03 
 
 		 530 aa  378  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462291  hitchhiker  0.000193551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2995  hypothetical protein  40.24 
 
 		 528 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2334  hypothetical protein  55 
 
 		 552 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0303  hypothetical protein  38.18 
 
 		 578 aa  269  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000587297 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2915  hypothetical protein  38.19 
 
 		 512 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3287  hypothetical protein  36.78 
 
 		 499 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3746  hypothetical protein  35.1 
 
 		 548 aa  253  8.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0608  hypothetical protein  35.18 
 
 		 574 aa  249  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4114  hypothetical protein  44.68 
 
 		 581 aa  233  9e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1348  hypothetical protein  30.62 
 
 		 568 aa  229  1e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1721  hypothetical protein  30.81 
 
 		 568 aa  226  1e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0619  hypothetical protein  40.44 
 
 		 510 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0642  hypothetical protein  39.22 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2677  hypothetical protein  34.32 
 
 		 569 aa  104  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127939  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.41 
 
 		 462 aa  100  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3492  nuclease  37.23 
 
 		 361 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0639009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1422  ParB-like nuclease  37.23 
 
 		 361 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3691  hypothetical protein  36.17 
 
 		 361 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.364785 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>