30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3379 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0997  hypothetical protein  65.87 
 
 		 552 aa  657    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1229  hypothetical protein  88.63 
 
 		 550 aa  939    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445379 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2292  hypothetical protein  80.57 
 
 		 559 aa  856    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0363731  hitchhiker  0.000163049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4144  hypothetical protein  78.52 
 
 		 530 aa  793    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462291  hitchhiker  0.000193551 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3379  hypothetical protein  100 
 
 		 554 aa  1108    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60985  normal  0.431334 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1317  hypothetical protein  80.04 
 
 		 559 aa  850    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.195654  normal  0.119576 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1451  hypothetical protein  79.66 
 
 		 551 aa  839    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0638  hypothetical protein  64.3 
 
 		 559 aa  634  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.0615794 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2815  hypothetical protein  60.44 
 
 		 573 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0565  hypothetical protein  59.39 
 
 		 541 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1664  hypothetical protein  53.38 
 
 		 574 aa  541  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0478  hypothetical protein  53.01 
 
 		 574 aa  530  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2334  hypothetical protein  82.06 
 
 		 552 aa  510  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1527  hypothetical protein  47.59 
 
 		 586 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.521319  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4454  hypothetical protein  44.62 
 
 		 575 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59070  hypothetical protein  44.29 
 
 		 579 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000160429  normal  0.0321205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2995  hypothetical protein  42.53 
 
 		 528 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2915  hypothetical protein  38.61 
 
 		 512 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1348  hypothetical protein  31.89 
 
 		 568 aa  256  1.0000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1721  hypothetical protein  31.71 
 
 		 568 aa  254  3e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3746  hypothetical protein  34.46 
 
 		 548 aa  253  8.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0303  hypothetical protein  33.39 
 
 		 578 aa  249  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000587297 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4114  hypothetical protein  35.05 
 
 		 581 aa  249  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0608  hypothetical protein  33.98 
 
 		 574 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0642  hypothetical protein  38.1 
 
 		 331 aa  193  6e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0619  hypothetical protein  33.54 
 
 		 510 aa  171  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2677  hypothetical protein  31.53 
 
 		 569 aa  111  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127939  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.02 
 
 		 462 aa  88.6  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1422  ParB-like nuclease  35.59 
 
 		 361 aa  44.3  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3492  nuclease  36.21 
 
 		 361 aa  43.9  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0639009  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>