31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0619 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0619  hypothetical protein  100 
 
 
510 aa  1046    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59070  hypothetical protein  40.62 
 
 
579 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000160429  normal  0.0321205 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2815  hypothetical protein  38.65 
 
 
573 aa  176  8e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4144  hypothetical protein  38.25 
 
 
530 aa  174  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462291  hitchhiker  0.000193551 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0478  hypothetical protein  38.25 
 
 
574 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4454  hypothetical protein  40.44 
 
 
575 aa  174  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0638  hypothetical protein  38.43 
 
 
559 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.0615794 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1348  hypothetical protein  37.65 
 
 
568 aa  172  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1721  hypothetical protein  36.88 
 
 
568 aa  172  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1451  hypothetical protein  33.84 
 
 
551 aa  171  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2334  hypothetical protein  37.85 
 
 
552 aa  170  6e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0997  hypothetical protein  37.45 
 
 
552 aa  170  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1664  hypothetical protein  37.86 
 
 
574 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3379  hypothetical protein  38.77 
 
 
554 aa  166  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60985  normal  0.431334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0303  hypothetical protein  40 
 
 
578 aa  166  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000587297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2995  hypothetical protein  36.29 
 
 
528 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0565  hypothetical protein  33.33 
 
 
541 aa  162  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1527  hypothetical protein  36.3 
 
 
586 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.521319  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1229  hypothetical protein  37.89 
 
 
550 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.445379 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4114  hypothetical protein  42.27 
 
 
581 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3287  hypothetical protein  37.25 
 
 
499 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3746  hypothetical protein  38.12 
 
 
548 aa  160  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2292  hypothetical protein  37 
 
 
559 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0363731  hitchhiker  0.000163049 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2915  hypothetical protein  36.44 
 
 
512 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1317  hypothetical protein  37.44 
 
 
559 aa  159  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.195654  normal  0.119576 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0642  hypothetical protein  35.29 
 
 
331 aa  153  8e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0608  hypothetical protein  36.32 
 
 
574 aa  149  9e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.48 
 
 
462 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2677  hypothetical protein  32.32 
 
 
569 aa  100  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127939  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1422  ParB-like nuclease  34.69 
 
 
361 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3492  nuclease  34.69 
 
 
361 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0639009  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>