31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2995 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2995  hypothetical protein  100 
 
 		 528 aa  1065    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2915  hypothetical protein  54.44 
 
 		 512 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3287  hypothetical protein  53.38 
 
 		 499 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1451  hypothetical protein  45.01 
 
 		 551 aa  373  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1229  hypothetical protein  43.68 
 
 		 550 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445379 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59070  hypothetical protein  42.5 
 
 		 579 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000160429  normal  0.0321205 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0565  hypothetical protein  43.27 
 
 		 541 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4144  hypothetical protein  43.46 
 
 		 530 aa  363  4e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462291  hitchhiker  0.000193551 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2292  hypothetical protein  44.21 
 
 		 559 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0363731  hitchhiker  0.000163049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4454  hypothetical protein  42.15 
 
 		 575 aa  362  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1317  hypothetical protein  44 
 
 		 559 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.195654  normal  0.119576 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1527  hypothetical protein  40.1 
 
 		 586 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.521319  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3379  hypothetical protein  44.16 
 
 		 554 aa  354  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60985  normal  0.431334 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2815  hypothetical protein  44.03 
 
 		 573 aa  350  4e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0478  hypothetical protein  40.77 
 
 		 574 aa  345  8.999999999999999e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0638  hypothetical protein  42.71 
 
 		 559 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.0615794 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1664  hypothetical protein  42 
 
 		 574 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0997  hypothetical protein  42.86 
 
 		 552 aa  336  5.999999999999999e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1721  hypothetical protein  31.61 
 
 		 568 aa  229  7e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1348  hypothetical protein  31.07 
 
 		 568 aa  228  2e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3746  hypothetical protein  34.94 
 
 		 548 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0303  hypothetical protein  32.68 
 
 		 578 aa  211  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000587297 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4114  hypothetical protein  45.34 
 
 		 581 aa  210  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0608  hypothetical protein  45.19 
 
 		 574 aa  209  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0642  hypothetical protein  40.28 
 
 		 331 aa  187  4e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0619  hypothetical protein  37.66 
 
 		 510 aa  164  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2677  hypothetical protein  32.73 
 
 		 569 aa  89.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127939  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.18 
 
 		 462 aa  87  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3492  nuclease  36.26 
 
 		 361 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0639009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1422  ParB-like nuclease  36.26 
 
 		 361 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2334  hypothetical protein  39.58 
 
 		 552 aa  43.5  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>