More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7414 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
462 aa  941    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.91 
 
 
294 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.391114 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0643  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.65 
 
 
273 aa  196  7e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0566  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.2 
 
 
294 aa  155  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2290  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.93 
 
 
291 aa  151  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00279341  hitchhiker  0.000107037 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1453  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.65 
 
 
291 aa  150  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1319  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.58 
 
 
291 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  0.0621083 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0636  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.97 
 
 
288 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.403916  normal  0.0791917 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.3 
 
 
291 aa  148  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527182  normal  0.755592 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2813  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.08 
 
 
283 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.841667  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4437  hypothetical protein  36.5 
 
 
286 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1534  chromosome partitioning related protein  33.96 
 
 
286 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475407  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2994  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.88 
 
 
280 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2333  chromosome partitioning protein  37.97 
 
 
296 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58910  chromosome partitioning related protein  36.5 
 
 
288 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000312998  normal  0.0159267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1230  putative chromosome partitioning protein ParA  38.72 
 
 
291 aa  143  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4142  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.1 
 
 
291 aa  142  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178725  hitchhiker  0.000102965 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0999  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.86 
 
 
288 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1666  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.9 
 
 
287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119343  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1719  chromosome partitioning-related protein  32.47 
 
 
283 aa  136  8e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1346  chromosome partitioning-related protein  32.47 
 
 
288 aa  136  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0605  hypothetical protein  35.89 
 
 
295 aa  134  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3286  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.57 
 
 
296 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.09 
 
 
292 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4116  hypothetical protein  34.06 
 
 
308 aa  124  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3748  hypothetical protein  33.57 
 
 
293 aa  124  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0301  hypothetical protein  33.7 
 
 
308 aa  123  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000410953 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3375  chromosome partitioning protein  32.18 
 
 
294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2677  hypothetical protein  41.22 
 
 
569 aa  104  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127939  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0619  hypothetical protein  41.48 
 
 
510 aa  104  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59070  hypothetical protein  40 
 
 
579 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000160429  normal  0.0321205 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1527  hypothetical protein  37.32 
 
 
586 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.521319  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4454  hypothetical protein  38.41 
 
 
575 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1348  hypothetical protein  41.73 
 
 
568 aa  98.2  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1721  hypothetical protein  41.73 
 
 
568 aa  98.2  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0642  hypothetical protein  42.97 
 
 
331 aa  97.4  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1229  hypothetical protein  38.84 
 
 
550 aa  90.9  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.445379 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1451  hypothetical protein  37.19 
 
 
551 aa  89.4  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3746  hypothetical protein  37.72 
 
 
548 aa  89  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3379  hypothetical protein  38.02 
 
 
554 aa  88.2  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60985  normal  0.431334 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2995  hypothetical protein  40.18 
 
 
528 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0303  hypothetical protein  35.17 
 
 
578 aa  87  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000587297 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0608  hypothetical protein  36.75 
 
 
574 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0997  hypothetical protein  38.02 
 
 
552 aa  85.5  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2334  hypothetical protein  38.02 
 
 
552 aa  85.1  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2292  hypothetical protein  37.19 
 
 
559 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0363731  hitchhiker  0.000163049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4144  hypothetical protein  38.02 
 
 
530 aa  84.7  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462291  hitchhiker  0.000193551 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1317  hypothetical protein  36.36 
 
 
559 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.195654  normal  0.119576 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0638  hypothetical protein  37.29 
 
 
559 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.0615794 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2815  hypothetical protein  38.02 
 
 
573 aa  84.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4114  hypothetical protein  38.94 
 
 
581 aa  81.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3287  hypothetical protein  37.62 
 
 
499 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2915  hypothetical protein  36.63 
 
 
512 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0565  hypothetical protein  36.44 
 
 
541 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0478  hypothetical protein  37.19 
 
 
574 aa  77.8  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1664  hypothetical protein  33.33 
 
 
574 aa  77.4  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.3 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  29.88 
 
 
327 aa  77  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.37 
 
 
316 aa  77  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4216  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.53 
 
 
322 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  33.73 
 
 
409 aa  75.1  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.39 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.39 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.39 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.28 
 
 
312 aa  72.8  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.63 
 
 
262 aa  72.4  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  27.13 
 
 
258 aa  72  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.4 
 
 
277 aa  72  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  27.12 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.82 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.93 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.46 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  28.28 
 
 
319 aa  69.7  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.67 
 
 
284 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  28.75 
 
 
290 aa  69.7  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.98 
 
 
317 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.34 
 
 
253 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.31 
 
 
256 aa  69.3  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.51 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.8 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.15 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  27.59 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 
352 aa  68.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.14 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.8 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.2 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.48 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.94 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  25.46 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  28.93 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.74 
 
 
339 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02865  putative ParA family protein  26.45 
 
 
254 aa  67  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.827974  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.49 
 
 
306 aa  67  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9001  replication protein A  26.62 
 
 
399 aa  67  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.55 
 
 
299 aa  67  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.61 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.787744  normal  0.0588103 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  29.61 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.46 
 
 
383 aa  66.6  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.57 
 
 
254 aa  66.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.287869  normal  0.696383 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.54 
 
 
264 aa  66.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>