More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1346 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_1346  chromosome partitioning-related protein  100 
 
 
288 aa  596  1e-169  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1719  chromosome partitioning-related protein  97.15 
 
 
283 aa  569  1e-161  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1534  chromosome partitioning related protein  40.07 
 
 
286 aa  217  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475407  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58910  chromosome partitioning related protein  40.67 
 
 
288 aa  215  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000312998  normal  0.0159267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4437  hypothetical protein  40.3 
 
 
286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3286  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.04 
 
 
296 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.67 
 
 
292 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0566  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.65 
 
 
294 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2994  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.22 
 
 
280 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1666  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.59 
 
 
287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119343  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2333  chromosome partitioning protein  37.09 
 
 
296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1453  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.27 
 
 
291 aa  182  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0636  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.41 
 
 
288 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.403916  normal  0.0791917 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1319  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.63 
 
 
291 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  0.0621083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0999  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.62 
 
 
288 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0605  hypothetical protein  40.7 
 
 
295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2813  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.32 
 
 
283 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.841667  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1230  putative chromosome partitioning protein ParA  38.15 
 
 
291 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2290  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.27 
 
 
291 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00279341  hitchhiker  0.000107037 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4142  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.91 
 
 
291 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178725  hitchhiker  0.000102965 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0301  hypothetical protein  36.79 
 
 
308 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000410953 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.46 
 
 
291 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527182  normal  0.755592 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4116  hypothetical protein  36.64 
 
 
308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0643  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.7 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3748  hypothetical protein  37.1 
 
 
293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3375  chromosome partitioning protein  35.34 
 
 
294 aa  161  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.5 
 
 
294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.391114 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.47 
 
 
462 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0480  hypothetical protein  34.19 
 
 
235 aa  87.8  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0680  sporulation initiation inhibitor protein soj  29.84 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.411466  n/a   
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC19  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  35.62 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.433322  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0255  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.66 
 
 
249 aa  65.1  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  25.93 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  26.83 
 
 
257 aa  63.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  25.42 
 
 
332 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.25 
 
 
329 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0237  chromosome partitioning ATPase  27.01 
 
 
279 aa  60.5  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2329  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.24 
 
 
259 aa  60.1  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.27 
 
 
362 aa  60.5  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0990  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.9 
 
 
269 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.77 
 
 
367 aa  59.7  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0930  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.31 
 
 
269 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  25.82 
 
 
263 aa  58.9  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1423  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.62 
 
 
328 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854251  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  27.5 
 
 
273 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4634  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.59 
 
 
238 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.28 
 
 
263 aa  58.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.21 
 
 
329 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_011735  BbuZS7_X32  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  31.61 
 
 
260 aa  57.4  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.0000524469  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.67 
 
 
249 aa  57  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4471  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.59 
 
 
238 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.12 
 
 
269 aa  56.6  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.89 
 
 
297 aa  56.6  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.19 
 
 
317 aa  57  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0035  putative protein sopA  29.23 
 
 
406 aa  56.6  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1916  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.71 
 
 
307 aa  56.6  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374804  hitchhiker  0.00135404 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0067  plasmid partition protein A  29.23 
 
 
406 aa  56.6  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0987  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.07 
 
 
269 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.294918  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.94 
 
 
263 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.08 
 
 
309 aa  56.6  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.77 
 
 
322 aa  56.2  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13239  hypothetical protein  27.44 
 
 
266 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.614127  normal  0.5818 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  27.01 
 
 
279 aa  55.8  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  31.71 
 
 
290 aa  55.8  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.89 
 
 
307 aa  55.8  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.42 
 
 
284 aa  55.8  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.58 
 
 
251 aa  55.8  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.33 
 
 
339 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5529  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.11 
 
 
258 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.151881 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3887  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.53 
 
 
405 aa  55.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  25.91 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4678  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.13 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993482  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.92 
 
 
262 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1068  tyrosine-protein kinase  34.06 
 
 
246 aa  55.5  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.08 
 
 
303 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_011731  BbuZS7_P35  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  31.37 
 
 
246 aa  54.7  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000108757  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.92 
 
 
266 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  25.1 
 
 
263 aa  55.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0009  plasmid-partitioning protein SopA  30.68 
 
 
388 aa  54.7  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0766545 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1833  hypothetical protein  28.81 
 
 
252 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.214744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.88 
 
 
279 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.88 
 
 
298 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.21 
 
 
299 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0002  hypothetical protein  28.8 
 
 
402 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00393773  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.08 
 
 
316 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2888  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.93 
 
 
274 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0188  chromosome partitioning protein ParA  29.48 
 
 
260 aa  53.9  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.88 
 
 
290 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4571  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.76 
 
 
404 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.12 
 
 
268 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.88 
 
 
290 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.08 
 
 
267 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.8 
 
 
273 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.43 
 
 
397 aa  53.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  23.69 
 
 
270 aa  53.5  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.3 
 
 
263 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1372  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.3 
 
 
263 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  33.33 
 
 
252 aa  53.5  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0095  ParA family chromosome partitioning ATPase  28.97 
 
 
261 aa  53.1  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  30.89 
 
 
784 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>