More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0106 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0106  soj protein  100 
 
 		 257 aa  519  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  85.6 
 
 		 257 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  72.76 
 
 		 257 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  72.37 
 
 		 257 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  75.1 
 
 		 257 aa  388  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3177  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  71.26 
 
 		 257 aa  363  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  67.7 
 
 		 257 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  64.4 
 
 		 254 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.95 
 
 		 255 aa  327  8e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  58.73 
 
 		 258 aa  325  6e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.11 
 
 		 253 aa  322  4e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.92 
 
 		 253 aa  319  3e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.08 
 
 		 253 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.71 
 
 		 259 aa  317  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4491  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.71 
 
 		 259 aa  317  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  58.4 
 
 		 258 aa  316  3e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  60.32 
 
 		 275 aa  316  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4502  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.32 
 
 		 314 aa  316  3e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  60.87 
 
 		 253 aa  315  4e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.77 
 
 		 267 aa  315  5e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.59 
 
 		 257 aa  315  6e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  58.63 
 
 		 249 aa  313  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  59.2 
 
 		 253 aa  311  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  59.2 
 
 		 253 aa  311  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  59.2 
 
 		 253 aa  311  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  59.2 
 
 		 253 aa  311  5.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  54.12 
 
 		 255 aa  311  5.999999999999999e-84  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  59.2 
 
 		 253 aa  311  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  59.2 
 
 		 253 aa  311  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  59.2 
 
 		 253 aa  311  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  59.2 
 
 		 253 aa  311  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  59.2 
 
 		 253 aa  311  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.82 
 
 		 295 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  59.2 
 
 		 253 aa  310  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.8 
 
 		 253 aa  308  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.71 
 
 		 253 aa  308  4e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  53.73 
 
 		 256 aa  307  9e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0307  hypothetical protein  53.75 
 
 		 262 aa  307  1.0000000000000001e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.285877 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58 
 
 		 253 aa  305  6e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.56 
 
 		 262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0241  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.95 
 
 		 300 aa  302  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.811562  normal  0.0256625 
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  53.7 
 
 		 258 aa  301  7.000000000000001e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  56.35 
 
 		 260 aa  301  9e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.69 
 
 		 262 aa  300  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1631  cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.31 
 
 		 263 aa  298  5e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423414  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  55.6 
 
 		 256 aa  298  8e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.73 
 
 		 264 aa  298  8e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.72 
 
 		 265 aa  295  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.38 
 
 		 273 aa  295  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  53.57 
 
 		 262 aa  294  7e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.78 
 
 		 254 aa  294  8e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.98 
 
 		 294 aa  292  4e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  56.35 
 
 		 259 aa  291  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.73 
 
 		 264 aa  291  5e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.35 
 
 		 270 aa  291  7e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.47 
 
 		 262 aa  291  8e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.69 
 
 		 255 aa  291  9e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  53.39 
 
 		 276 aa  290  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.37 
 
 		 256 aa  291  1e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.76 
 
 		 261 aa  291  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  54.8 
 
 		 294 aa  291  1e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.97 
 
 		 255 aa  290  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  53.75 
 
 		 262 aa  290  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.6 
 
 		 266 aa  290  2e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.75 
 
 		 253 aa  290  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.72 
 
 		 254 aa  289  3e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.47 
 
 		 262 aa  289  3e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.94 
 
 		 265 aa  288  4e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3277  chromosome segregation ATPase  52.78 
 
 		 259 aa  288  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161475  normal  0.418275 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.02 
 
 		 256 aa  288  6e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.52 
 
 		 262 aa  288  9e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0112  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.78 
 
 		 259 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  53.75 
 
 		 262 aa  287  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2960  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.78 
 
 		 259 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.78 
 
 		 259 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.95 
 
 		 262 aa  286  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3318  sporulation initiation inhibitor protein Soj  53.17 
 
 		 256 aa  286  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.94 
 
 		 301 aa  286  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  55.16 
 
 		 253 aa  286  2e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.12 
 
 		 317 aa  286  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  52.34 
 
 		 265 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.97 
 
 		 262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.97 
 
 		 262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.78 
 
 		 256 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.97 
 
 		 262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  52.34 
 
 		 265 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.97 
 
 		 262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  53.12 
 
 		 262 aa  285  5e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  53.12 
 
 		 262 aa  285  5e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  52.53 
 
 		 262 aa  285  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  52.53 
 
 		 262 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  52.8 
 
 		 253 aa  285  7e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  53.12 
 
 		 262 aa  285  7e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  53.97 
 
 		 262 aa  284  8e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  54.51 
 
 		 262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  53.36 
 
 		 265 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0096  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.78 
 
 		 259 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.560799  normal  0.715658 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.02 
 
 		 253 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  52.78 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  52.78 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>