More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2676 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
294 aa  598  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.391114 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0643  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.17 
 
 
273 aa  206  6e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.91 
 
 
462 aa  195  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1534  chromosome partitioning related protein  35.92 
 
 
286 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475407  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2994  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.62 
 
 
280 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0566  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.46 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58910  chromosome partitioning related protein  36.73 
 
 
288 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000312998  normal  0.0159267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4437  hypothetical protein  35.84 
 
 
286 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.62 
 
 
292 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1346  chromosome partitioning-related protein  32.5 
 
 
288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3286  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.97 
 
 
296 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1719  chromosome partitioning-related protein  32.14 
 
 
283 aa  135  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2290  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.38 
 
 
291 aa  132  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00279341  hitchhiker  0.000107037 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1230  putative chromosome partitioning protein ParA  37.68 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2813  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.97 
 
 
283 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.841667  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1319  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.03 
 
 
291 aa  130  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  0.0621083 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1453  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.68 
 
 
291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0636  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.68 
 
 
288 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.403916  normal  0.0791917 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4142  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.46 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178725  hitchhiker  0.000102965 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2333  chromosome partitioning protein  36.75 
 
 
296 aa  126  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0999  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.75 
 
 
288 aa  125  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.32 
 
 
291 aa  125  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527182  normal  0.755592 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1666  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.55 
 
 
287 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119343  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0605  hypothetical protein  31.06 
 
 
295 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3375  chromosome partitioning protein  33.67 
 
 
294 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3748  hypothetical protein  31.06 
 
 
293 aa  96.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4116  hypothetical protein  31.16 
 
 
308 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0301  hypothetical protein  30.48 
 
 
308 aa  89.7  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000410953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4233  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.87 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02865  putative ParA family protein  28.3 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.827974  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2886  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.91 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0006  ParA family protein  27.59 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0843826  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1301  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
313 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106287  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.73 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  32.38 
 
 
408 aa  65.9  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  28.72 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2028  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.28 
 
 
322 aa  65.9  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.421351  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5239  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.86 
 
 
259 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000091984  hitchhiker  0.0000000000884158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  28.83 
 
 
263 aa  65.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3666  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.95 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0435  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2748  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.51 
 
 
313 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.815603 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1494  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.15 
 
 
243 aa  64.7  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134391  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.78 
 
 
263 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.018865 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5560  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.31 
 
 
256 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3421  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.16 
 
 
257 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.786634  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  27.41 
 
 
263 aa  63.9  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H08  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  26.86 
 
 
251 aa  63.9  0.000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.129369  n/a   
 
 
-
 
NC_011722  BbuZS7_N36  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  29.65 
 
 
251 aa  63.9  0.000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.113444  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.04 
 
 
294 aa  63.9  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1796  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.99 
 
 
268 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.852765  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  25.18 
 
 
259 aa  62.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  29.55 
 
 
259 aa  62.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.77 
 
 
408 aa  62.8  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.08 
 
 
404 aa  62.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  26.32 
 
 
258 aa  62.4  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.01 
 
 
263 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1372  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.01 
 
 
263 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.33 
 
 
278 aa  62.4  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  29.39 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.35 
 
 
397 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.9 
 
 
265 aa  62  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.47 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.84 
 
 
307 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1116  chromosome partitioning ATPase  25.94 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.897501  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  34.76 
 
 
371 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0255  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.99 
 
 
249 aa  61.2  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011780  BbuZS7_F12  putative PF32  24.91 
 
 
254 aa  60.8  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0468  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.21 
 
 
254 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2086  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.74 
 
 
255 aa  61.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.98 
 
 
262 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.73 
 
 
263 aa  61.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  27.08 
 
 
348 aa  60.8  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  25.99 
 
 
259 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1916  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.47 
 
 
307 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374804  hitchhiker  0.00135404 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1526  parA family protein  25.37 
 
 
262 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429591  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  25.99 
 
 
258 aa  60.8  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.74 
 
 
302 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.2 
 
 
322 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0025  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.07 
 
 
353 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599931  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  30.65 
 
 
265 aa  60.1  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4507  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.56 
 
 
354 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  27.7 
 
 
259 aa  60.1  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  24.07 
 
 
255 aa  60.1  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K15  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  21.11 
 
 
249 aa  60.5  0.00000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000000399891  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  30.65 
 
 
265 aa  60.1  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.26 
 
 
279 aa  60.1  0.00000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.47 
 
 
259 aa  60.1  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.37 
 
 
261 aa  60.1  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.73 
 
 
254 aa  59.7  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.18 
 
 
303 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0480  hypothetical protein  45.9 
 
 
235 aa  59.7  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.62 
 
 
263 aa  59.7  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3541  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.69 
 
 
285 aa  59.7  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555008  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0987  partition protein, ParA-like  31.87 
 
 
299 aa  59.3  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.000325119  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.02 
 
 
329 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1671  chromosome partitioning ATPase  29.51 
 
 
471 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000001751  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6104  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.16 
 
 
254 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.47 
 
 
249 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0936  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.1 
 
 
255 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.114878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>