More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1301 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1301  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
313 aa  644    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106287  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2748  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  72.12 
 
 
313 aa  471  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.815603 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2028  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  69.23 
 
 
322 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.421351  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4233  cobyrinic acid ac-diamide synthase  65.16 
 
 
330 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2181  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.39 
 
 
306 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000966803  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1555  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.27 
 
 
313 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3772  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.49 
 
 
304 aa  109  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507747  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2474  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.05 
 
 
294 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00522516  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.19 
 
 
277 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2566  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.92 
 
 
282 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.773766  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0441  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.58 
 
 
314 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000798578  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0920  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.58 
 
 
314 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.0000000000171601  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.75 
 
 
350 aa  102  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0651125  hitchhiker  0.0000101821 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.83 
 
 
268 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4349  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.54 
 
 
295 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1288  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.8 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.435318  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1257  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.8 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0223  putative regulatory protein  33.17 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0777  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.66 
 
 
257 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3592  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.77 
 
 
298 aa  92.8  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.161207  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1467  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.15 
 
 
274 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.162034  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.43 
 
 
261 aa  90.5  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  25.74 
 
 
258 aa  90.5  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  33.67 
 
 
258 aa  90.9  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.17 
 
 
265 aa  89.4  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  34.52 
 
 
408 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1153  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
258 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.488153  normal  0.157692 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.61 
 
 
317 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0744  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.96 
 
 
315 aa  87.8  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000594465  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  28.99 
 
 
257 aa  87.8  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  32.16 
 
 
409 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0022  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.58 
 
 
257 aa  87  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.695943  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.62 
 
 
270 aa  86.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.33 
 
 
290 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.33 
 
 
290 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.4 
 
 
257 aa  86.7  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.14 
 
 
279 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.24 
 
 
258 aa  86.3  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0855  ParA family protein  25.69 
 
 
365 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  30.24 
 
 
256 aa  86.3  7e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4678  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.18 
 
 
267 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993482  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.39 
 
 
317 aa  85.9  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  27.89 
 
 
264 aa  85.9  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  31.16 
 
 
259 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0006  ParA family protein  28.36 
 
 
258 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0843826  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.78 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  27.04 
 
 
253 aa  85.1  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4023  ATPase, ParA type  34.69 
 
 
392 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1423  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.08 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854251  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.99 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00028  chromosome partioning protein  28.76 
 
 
260 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.287581  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1407  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.63 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  29.26 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.53 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02865  putative ParA family protein  29.05 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.827974  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.07 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.53 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1028  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.61 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  31.66 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.35 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.71944  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.53 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.73 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3786  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.54 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116138  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.53 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6501  plasmid partitioning protein RepA  31.44 
 
 
404 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13239  hypothetical protein  30.77 
 
 
266 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.614127  normal  0.5818 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  30.88 
 
 
285 aa  84  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4519  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.5 
 
 
313 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.25 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.14 
 
 
407 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.31 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000361786  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  29.36 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  32.99 
 
 
408 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.99 
 
 
401 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5376  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.84 
 
 
443 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00931432  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.51 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.41 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.72 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.29 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.64 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  26.62 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.25 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22160  chromosome partitioning ATPase  32.47 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  28.76 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5239  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.79 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000091984  hitchhiker  0.0000000000884158 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  30.65 
 
 
371 aa  82.4  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0237  chromosome partitioning ATPase  27.32 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  27.36 
 
 
258 aa  82.4  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  28.75 
 
 
319 aa  82  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.28 
 
 
263 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  27.17 
 
 
255 aa  82  0.00000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5246  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.3 
 
 
299 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.25 
 
 
271 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4190  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.14 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  30.46 
 
 
405 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.49 
 
 
398 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3591  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.51 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1114  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.54 
 
 
272 aa  82.4  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114228  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2299  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.58 
 
 
323 aa  82.4  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315391  normal  0.0688217 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.14 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>