More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0566 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0566  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
294 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0999  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  74.64 
 
 
288 aa  395  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2333  chromosome partitioning protein  75 
 
 
296 aa  397  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1453  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  74.18 
 
 
291 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0636  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  73.57 
 
 
288 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.403916  normal  0.0791917 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2290  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  73.36 
 
 
291 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00279341  hitchhiker  0.000107037 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1319  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  73.72 
 
 
291 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  0.0621083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4142  cobyrinic acid ac-diamide synthase  73.36 
 
 
291 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178725  hitchhiker  0.000102965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1230  putative chromosome partitioning protein ParA  71.74 
 
 
291 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2813  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  72.1 
 
 
283 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.841667  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  72.26 
 
 
291 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527182  normal  0.755592 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1666  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  65.71 
 
 
287 aa  347  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2994  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.25 
 
 
280 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.6 
 
 
292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3286  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.72 
 
 
296 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1534  chromosome partitioning related protein  49.45 
 
 
286 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475407  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58910  chromosome partitioning related protein  52.43 
 
 
288 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000312998  normal  0.0159267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4437  hypothetical protein  50.37 
 
 
286 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0643  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.07 
 
 
273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0605  hypothetical protein  42.25 
 
 
295 aa  206  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3748  hypothetical protein  41.96 
 
 
293 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3375  chromosome partitioning protein  42.71 
 
 
294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0301  hypothetical protein  39.32 
 
 
308 aa  192  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000410953 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1346  chromosome partitioning-related protein  36.65 
 
 
288 aa  191  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4116  hypothetical protein  40.28 
 
 
308 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1719  chromosome partitioning-related protein  36.23 
 
 
283 aa  186  4e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0480  hypothetical protein  39.93 
 
 
235 aa  163  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.46 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.391114 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.2 
 
 
462 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.88 
 
 
263 aa  87  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  31.58 
 
 
371 aa  86.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  35.8 
 
 
263 aa  86.3  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.47 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.47 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.47 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.47 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.8 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1372  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.8 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.29 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  37.06 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.8 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.018865 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.42 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  36.47 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.66 
 
 
367 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.29 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1384  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.57 
 
 
263 aa  79  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.72 
 
 
284 aa  79  0.00000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.04 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.96 
 
 
312 aa  77  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.67 
 
 
303 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  29.07 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  30.48 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1494  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.81 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134391  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  31.03 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.32 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.45 
 
 
287 aa  75.5  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.66 
 
 
362 aa  75.1  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.13 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  32.57 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  32.57 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.23 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC19  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  33.71 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.433322  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13239  hypothetical protein  33.33 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.614127  normal  0.5818 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.33 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.33 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  35.33 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.58 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3421  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.76 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.786634  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3068  chromosome partitioning protein, sporulation initiation inhibitor protein Soj  33.93 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.77 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.33 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.71 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.42 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  28.96 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.77 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.77 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  37.9 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  33.55 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2956  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.05 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.77 
 
 
307 aa  72.4  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.9 
 
 
337 aa  72.4  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1916  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.39 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374804  hitchhiker  0.00135404 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.99 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.56 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  34.62 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  29.92 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1641  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.19 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.98 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.09 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1968  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.48 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  26.69 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.13 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.56 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.22 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.77 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  28.18 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  35.76 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  33.12 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.01 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  31.95 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>