More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0106 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  100 
 
 
256 aa  523  1e-148  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.6 
 
 
257 aa  345  5e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  66 
 
 
253 aa  345  5e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  62.89 
 
 
257 aa  340  1e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.11 
 
 
255 aa  340  1e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  64.14 
 
 
253 aa  338  5e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  64.14 
 
 
253 aa  338  5e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  64.14 
 
 
253 aa  338  5e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  64.14 
 
 
253 aa  338  5e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  64.14 
 
 
253 aa  338  5e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  64.14 
 
 
253 aa  338  5e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  64.14 
 
 
253 aa  338  5e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  64.14 
 
 
253 aa  338  5e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.35 
 
 
253 aa  338  7e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  63.75 
 
 
253 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.4 
 
 
253 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.35 
 
 
253 aa  334  7e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  62.11 
 
 
258 aa  333  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  62.35 
 
 
253 aa  331  7.000000000000001e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.95 
 
 
253 aa  326  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.4 
 
 
253 aa  325  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  61.51 
 
 
253 aa  323  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.2 
 
 
253 aa  323  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  61.35 
 
 
253 aa  322  3e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  60.82 
 
 
249 aa  315  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  58.7 
 
 
348 aa  314  9.999999999999999e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.47 
 
 
295 aa  308  5e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.23 
 
 
253 aa  308  6.999999999999999e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.87 
 
 
255 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.5 
 
 
254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.89 
 
 
294 aa  304  7e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  55.64 
 
 
257 aa  305  7e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  56 
 
 
262 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.77 
 
 
254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  54.72 
 
 
261 aa  300  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  56.81 
 
 
260 aa  301  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.88 
 
 
266 aa  300  1e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.47 
 
 
265 aa  298  5e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  55.6 
 
 
257 aa  298  8e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  56.63 
 
 
294 aa  298  8e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.86 
 
 
265 aa  297  1e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  55.6 
 
 
254 aa  296  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  55.29 
 
 
265 aa  293  2e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  56.08 
 
 
265 aa  293  2e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.25 
 
 
257 aa  290  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  53.15 
 
 
370 aa  290  1e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.12 
 
 
267 aa  290  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.9 
 
 
265 aa  290  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.6 
 
 
254 aa  289  4e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  54.9 
 
 
265 aa  288  6e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2439  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.29 
 
 
265 aa  287  9e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  51.37 
 
 
255 aa  287  1e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  51.37 
 
 
256 aa  287  1e-76  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  51.97 
 
 
258 aa  287  1e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.34 
 
 
263 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.09 
 
 
257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.88 
 
 
257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.73 
 
 
270 aa  285  5e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.2 
 
 
263 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  55.47 
 
 
253 aa  284  8e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.36 
 
 
284 aa  284  9e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.4 
 
 
257 aa  284  9e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.73 
 
 
264 aa  283  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.95 
 
 
263 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  52.96 
 
 
273 aa  283  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  54.15 
 
 
270 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3373  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.26 
 
 
410 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3739  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.73 
 
 
257 aa  284  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.512562  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  53.2 
 
 
263 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0307  hypothetical protein  53.2 
 
 
262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.285877 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.7 
 
 
257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.2 
 
 
263 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  54 
 
 
262 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.95 
 
 
278 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.76 
 
 
262 aa  281  5.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  51.76 
 
 
265 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  51.76 
 
 
264 aa  281  7.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  51.17 
 
 
258 aa  281  9e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  52.4 
 
 
263 aa  280  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2752  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.8 
 
 
262 aa  281  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  52.8 
 
 
262 aa  280  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.96 
 
 
284 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.91 
 
 
264 aa  280  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.44 
 
 
317 aa  280  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  55.2 
 
 
265 aa  280  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.57 
 
 
286 aa  280  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  52.8 
 
 
262 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.79 
 
 
270 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.2 
 
 
284 aa  279  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.8 
 
 
256 aa  279  3e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.76 
 
 
470 aa  279  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.57 
 
 
289 aa  278  4e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  54.4 
 
 
266 aa  279  4e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.79 
 
 
274 aa  278  5e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.56 
 
 
282 aa  278  5e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15195 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  53.54 
 
 
330 aa  278  5e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.57 
 
 
271 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.57 
 
 
284 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  51.81 
 
 
262 aa  278  7e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4491  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.95 
 
 
259 aa  278  8e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>