More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3375 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3375  chromosome partitioning protein  100 
 
 
294 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3748  hypothetical protein  68.55 
 
 
293 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0605  hypothetical protein  63.7 
 
 
295 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4116  hypothetical protein  63.96 
 
 
308 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0301  hypothetical protein  63.73 
 
 
308 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000410953 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1534  chromosome partitioning related protein  42.01 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475407  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58910  chromosome partitioning related protein  42.6 
 
 
288 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000312998  normal  0.0159267 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2813  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.4 
 
 
283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.841667  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0566  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.71 
 
 
294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4437  hypothetical protein  41.52 
 
 
286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.66 
 
 
292 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2333  chromosome partitioning protein  42.46 
 
 
296 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0999  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.61 
 
 
288 aa  192  8e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0636  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.84 
 
 
288 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.403916  normal  0.0791917 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1666  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.01 
 
 
287 aa  185  8e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119343  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3286  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.77 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1230  putative chromosome partitioning protein ParA  41.7 
 
 
291 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.91 
 
 
291 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527182  normal  0.755592 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1453  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.4 
 
 
291 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4142  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.4 
 
 
291 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178725  hitchhiker  0.000102965 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2994  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.46 
 
 
280 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1319  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.11 
 
 
291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  0.0621083 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2290  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.77 
 
 
291 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00279341  hitchhiker  0.000107037 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1719  chromosome partitioning-related protein  35.69 
 
 
283 aa  163  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1346  chromosome partitioning-related protein  35.34 
 
 
288 aa  161  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0643  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.21 
 
 
273 aa  153  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.18 
 
 
462 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.67 
 
 
294 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.391114 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0480  hypothetical protein  29.08 
 
 
235 aa  89.4  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.28 
 
 
293 aa  62.4  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  33.12 
 
 
263 aa  59.3  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.81 
 
 
263 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0237  chromosome partitioning ATPase  28.73 
 
 
279 aa  58.2  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.77 
 
 
263 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1372  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.77 
 
 
263 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.81 
 
 
263 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.3 
 
 
317 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.81 
 
 
263 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.81 
 
 
263 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.91 
 
 
287 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1068  tyrosine-protein kinase  42.7 
 
 
246 aa  57.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.28 
 
 
362 aa  57  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  32.12 
 
 
784 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.45 
 
 
269 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  33.07 
 
 
782 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  26.32 
 
 
319 aa  56.6  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.77 
 
 
306 aa  56.2  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.37 
 
 
312 aa  56.2  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.24 
 
 
230 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.05 
 
 
263 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  35.63 
 
 
405 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.24 
 
 
230 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  29.8 
 
 
290 aa  55.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  31.82 
 
 
293 aa  55.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  28.48 
 
 
332 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0141  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.33 
 
 
228 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.47 
 
 
337 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  30.41 
 
 
371 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1494  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.63 
 
 
243 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134391  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  25 
 
 
315 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0136  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.33 
 
 
228 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.68 
 
 
263 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.54 
 
 
263 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.018865 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.41 
 
 
262 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  27.03 
 
 
253 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  27.03 
 
 
253 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  27.03 
 
 
253 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  27.03 
 
 
253 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  27.03 
 
 
253 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  27.03 
 
 
253 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  31.67 
 
 
779 aa  53.9  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  27.03 
 
 
253 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  27.03 
 
 
253 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3068  chromosome partitioning protein, sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.73 
 
 
265 aa  53.9  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.28 
 
 
297 aa  53.9  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  31.41 
 
 
263 aa  53.9  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.41 
 
 
262 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.41 
 
 
262 aa  53.5  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.41 
 
 
262 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.41 
 
 
262 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.32 
 
 
298 aa  53.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  27.08 
 
 
397 aa  53.5  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  30.41 
 
 
262 aa  53.1  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  27.03 
 
 
253 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  30.23 
 
 
403 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  30.41 
 
 
262 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  30.41 
 
 
262 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.81 
 
 
268 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.11 
 
 
303 aa  53.1  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.35 
 
 
263 aa  52.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.61 
 
 
261 aa  53.1  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  30.41 
 
 
262 aa  52.8  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  26.28 
 
 
314 aa  52.8  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  33.33 
 
 
746 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  33.58 
 
 
246 aa  52.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  33.33 
 
 
746 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  33.33 
 
 
746 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.66 
 
 
253 aa  52.4  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.143789 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  33.09 
 
 
258 aa  52  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.48 
 
 
405 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>