More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3748 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3748  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  604  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0605  hypothetical protein  76.51 
 
 		 295 aa  471  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3375  chromosome partitioning protein  68.55 
 
 		 294 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0301  hypothetical protein  63.96 
 
 		 308 aa  374  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000410953 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4116  hypothetical protein  64.54 
 
 		 308 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1534  chromosome partitioning related protein  42.91 
 
 		 286 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475407  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58910  chromosome partitioning related protein  43.21 
 
 		 288 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000312998  normal  0.0159267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4437  hypothetical protein  43.21 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0566  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.96 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0636  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.82 
 
 		 288 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.403916  normal  0.0791917 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.01 
 
 		 292 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2813  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.06 
 
 		 283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.841667  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3286  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.92 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.69 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527182  normal  0.755592 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1453  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.82 
 
 		 291 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1666  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.76 
 
 		 287 aa  193  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119343  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1230  putative chromosome partitioning protein ParA  42.37 
 
 		 291 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2333  chromosome partitioning protein  42.05 
 
 		 296 aa  191  8e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1319  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.37 
 
 		 291 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  0.0621083 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2994  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.35 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0999  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.9 
 
 		 288 aa  189  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2290  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.11 
 
 		 291 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00279341  hitchhiker  0.000107037 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4142  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.05 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178725  hitchhiker  0.000102965 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1346  chromosome partitioning-related protein  37.1 
 
 		 288 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1719  chromosome partitioning-related protein  37.1 
 
 		 283 aa  162  7e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0643  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.61 
 
 		 273 aa  145  9e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.57 
 
 		 462 aa  119  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.06 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391114 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0480  hypothetical protein  28.87 
 
 		 235 aa  92  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1068  tyrosine-protein kinase  33.33 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0237  chromosome partitioning ATPase  29.41 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  36.64 
 
 		 722 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  32.03 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  34.92 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.22 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  33.81 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  32.81 
 
 		 782 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.05 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4704  hypothetical protein  29.11 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.155939  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  35.94 
 
 		 525 aa  57  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  32.04 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  32.42 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.04 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1372  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.04 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.09 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3070  ParA-like chromosome partition protein  34.13 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  36.8 
 
 		 779 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  35.71 
 
 		 753 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.12 
 
 		 230 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0136  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.4 
 
 		 228 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.03 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.11 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.11 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  31.61 
 
 		 496 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3210  chromosome segregation ATPase  29.13 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0141  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.4 
 
 		 228 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3068  chromosome partitioning protein, sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.11 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.12 
 
 		 230 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.11 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  30.47 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.11 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  30.89 
 
 		 770 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.67 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0930  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.32 
 
 		 269 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  41.18 
 
 		 492 aa  53.9  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  29.41 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  27.75 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.94 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  35.71 
 
 		 454 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.47 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  31.41 
 
 		 265 aa  53.5  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.18 
 
 		 317 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  28.89 
 
 		 258 aa  53.5  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1288  putative ATPase  27.95 
 
 		 369 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  35.25 
 
 		 585 aa  53.5  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.04 
 
 		 263 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.018865 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.28 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3043  putative ATPase  27.51 
 
 		 369 aa  53.1  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  34.19 
 
 		 463 aa  53.1  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  32.28 
 
 		 257 aa  53.1  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.95 
 
 		 249 aa  53.1  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  33.75 
 
 		 265 aa  52.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1172  cpsD protein  36.15 
 
 		 229 aa  52.8  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.748604  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  27.11 
 
 		 265 aa  52.8  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0987  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.79 
 
 		 269 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.294918  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  30.22 
 
 		 469 aa  52.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  38.89 
 
 		 790 aa  52.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.51 
 
 		 575 aa  52.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 		 266 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  29.33 
 
 		 721 aa  52.4  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  29.87 
 
 		 253 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2615  non-specific protein-tyrosine kinase  42.86 
 
 		 244 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.11951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  30.59 
 
 		 403 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.82 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2872  putative ATPase  25.22 
 
 		 369 aa  51.6  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.87 
 
 		 253 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  29.87 
 
 		 253 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.87 
 
 		 253 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  31.54 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  33.07 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>