More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2815 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 		 770 aa  1569    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  35.53 
 
 		 755 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  34.12 
 
 		 756 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  31.65 
 
 		 737 aa  392  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  31.97 
 
 		 738 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  30.35 
 
 		 731 aa  342  1e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  28.73 
 
 		 726 aa  320  6e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  36.5 
 
 		 527 aa  308  3e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  26.89 
 
 		 753 aa  280  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  27.82 
 
 		 730 aa  273  7e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  28.26 
 
 		 734 aa  260  9e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  25.54 
 
 		 708 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  26.58 
 
 		 872 aa  246  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  26.74 
 
 		 779 aa  245  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.26 
 
 		 745 aa  239  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  26.39 
 
 		 756 aa  235  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  26.87 
 
 		 711 aa  234  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  27.1 
 
 		 743 aa  233  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  26.25 
 
 		 756 aa  232  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  27.22 
 
 		 797 aa  227  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  27.35 
 
 		 721 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  26.03 
 
 		 738 aa  212  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  25.66 
 
 		 750 aa  211  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  27.48 
 
 		 774 aa  203  9e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  25.03 
 
 		 753 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  25.46 
 
 		 758 aa  200  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  24.97 
 
 		 745 aa  199  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  25.3 
 
 		 772 aa  198  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  24.69 
 
 		 772 aa  197  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  27.42 
 
 		 804 aa  197  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  24.87 
 
 		 758 aa  197  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3175  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.62 
 
 		 710 aa  191  5.999999999999999e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.659876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0587  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 		 710 aa  191  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.9 
 
 		 739 aa  191  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  24.24 
 
 		 788 aa  190  9e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  24.67 
 
 		 737 aa  190  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  25.22 
 
 		 778 aa  187  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3557  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.42 
 
 		 710 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.2 
 
 		 722 aa  185  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.08 
 
 		 748 aa  185  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  24.46 
 
 		 727 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.41 
 
 		 779 aa  179  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  25.36 
 
 		 710 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.13 
 
 		 739 aa  175  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  26.61 
 
 		 790 aa  174  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  24.19 
 
 		 782 aa  173  9e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  28.06 
 
 		 722 aa  167  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  25.04 
 
 		 789 aa  165  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  26.08 
 
 		 733 aa  162  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  23.49 
 
 		 776 aa  162  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  24.02 
 
 		 766 aa  161  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.24 
 
 		 764 aa  157  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  25.04 
 
 		 734 aa  156  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  25.04 
 
 		 806 aa  154  7e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  23.33 
 
 		 756 aa  152  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1816  protein-tyrosine kinase  25.09 
 
 		 755 aa  152  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  23.35 
 
 		 736 aa  151  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  25.87 
 
 		 820 aa  150  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  24.42 
 
 		 795 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  25.21 
 
 		 767 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.28 
 
 		 720 aa  147  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.28 
 
 		 759 aa  145  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  25.38 
 
 		 790 aa  143  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  24.88 
 
 		 775 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  23.95 
 
 		 739 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  28.36 
 
 		 464 aa  140  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  32.96 
 
 		 463 aa  140  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.61 
 
 		 726 aa  140  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  24.92 
 
 		 747 aa  140  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.58 
 
 		 724 aa  140  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  25.31 
 
 		 783 aa  138  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  22.98 
 
 		 732 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.77 
 
 		 730 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  23.44 
 
 		 739 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  22.71 
 
 		 742 aa  136  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  31.96 
 
 		 466 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  25.04 
 
 		 771 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  24.92 
 
 		 789 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.65 
 
 		 751 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  23.44 
 
 		 739 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  25.33 
 
 		 750 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  23.27 
 
 		 739 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1794  chain length determinant protein  26.12 
 
 		 461 aa  135  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  23.06 
 
 		 740 aa  135  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  22.45 
 
 		 803 aa  135  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.55 
 
 		 726 aa  134  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2106  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.3 
 
 		 724 aa  135  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 		 776 aa  134  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  21.9 
 
 		 802 aa  134  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  22.39 
 
 		 786 aa  134  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  24.42 
 
 		 741 aa  134  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.7 
 
 		 778 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3622  hypothetical protein  24.38 
 
 		 760 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.68 
 
 		 720 aa  132  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  29.2 
 
 		 505 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1523  non-specific protein-tyrosine kinase  27.18 
 
 		 718 aa  132  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  32.34 
 
 		 496 aa  132  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  23.01 
 
 		 741 aa  132  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.77 
 
 		 701 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  30.13 
 
 		 747 aa  131  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0576306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>