More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2762 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
748 aa  1514    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  38.76 
 
 
739 aa  512  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  37.82 
 
 
745 aa  466  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  36.89 
 
 
753 aa  435  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 
772 aa  422  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  34.12 
 
 
758 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  34.97 
 
 
758 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  35.11 
 
 
782 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  35.38 
 
 
756 aa  395  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.47 
 
 
750 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.3 
 
 
779 aa  363  5.0000000000000005e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  32.89 
 
 
778 aa  356  7.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.05 
 
 
764 aa  355  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  31.1 
 
 
788 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  31.25 
 
 
776 aa  330  4e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.82 
 
 
751 aa  323  8e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  29.91 
 
 
790 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  27.94 
 
 
789 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.49 
 
 
785 aa  275  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389826  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  29.1 
 
 
756 aa  275  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  28.72 
 
 
789 aa  266  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  28.72 
 
 
771 aa  266  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  27.53 
 
 
750 aa  237  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  26.88 
 
 
734 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  27.79 
 
 
710 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  26.72 
 
 
730 aa  229  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  26.51 
 
 
738 aa  220  7.999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  26.33 
 
 
737 aa  216  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.69 
 
 
701 aa  203  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.46 
 
 
759 aa  200  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5390  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.15 
 
 
491 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.300037 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0674  lipopolysaccharide biosynthesis  31.24 
 
 
764 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0975294  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  25.96 
 
 
756 aa  198  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  25.38 
 
 
743 aa  195  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  25.07 
 
 
755 aa  195  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4355  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.2 
 
 
696 aa  188  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  31.06 
 
 
713 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  24.25 
 
 
770 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1073  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 
728 aa  184  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649181  normal  0.290523 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  25.18 
 
 
726 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  31.46 
 
 
773 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  30.44 
 
 
715 aa  179  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  30.68 
 
 
742 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  26.12 
 
 
731 aa  180  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  24.34 
 
 
738 aa  177  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  22.4 
 
 
756 aa  177  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  25.43 
 
 
872 aa  174  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2697  lipopolysaccharide biosynthesis  30.58 
 
 
769 aa  173  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  24.26 
 
 
779 aa  172  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.89 
 
 
776 aa  171  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4243  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.63 
 
 
595 aa  171  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0247  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.51 
 
 
478 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.484556 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  25 
 
 
753 aa  167  9e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1008  lipopolysaccharide biosynthesis  30.67 
 
 
687 aa  164  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597439  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1111  lipopolysaccharide biosynthesis  25.45 
 
 
688 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4578  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.17 
 
 
491 aa  163  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290602  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5050  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.02 
 
 
707 aa  162  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.376238  normal  0.397595 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  25.94 
 
 
737 aa  161  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4589  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.19 
 
 
707 aa  160  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.260554 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0101  polysaccharide accessory transport protein, putative  28.21 
 
 
572 aa  157  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4605  polysaccharide biosynthesis transporter  31.44 
 
 
763 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.599014 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0093  putative polysaccharide accessory transport protein  28.24 
 
 
572 aa  156  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6014  exopolysaccharide polymerization/transport protein  28.54 
 
 
737 aa  157  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  24.11 
 
 
734 aa  153  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.79 
 
 
766 aa  152  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2505  exopolysaccharide transport protein family  25.07 
 
 
735 aa  150  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0737  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.43 
 
 
704 aa  150  9e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.875761  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  24.23 
 
 
727 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  22.79 
 
 
721 aa  146  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4210  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.08 
 
 
548 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2194  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.82 
 
 
804 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1859  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.82 
 
 
804 aa  140  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708627  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  27.55 
 
 
709 aa  140  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  23.02 
 
 
745 aa  140  8.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4500  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 
537 aa  140  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177123  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1157  exopolysaccharide transport protein family  27.66 
 
 
720 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.238721  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0308  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.07 
 
 
737 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0387  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.14 
 
 
509 aa  134  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  24.55 
 
 
711 aa  134  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.05 
 
 
726 aa  134  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3369  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.93 
 
 
731 aa  134  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  25.93 
 
 
747 aa  132  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4353  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.65 
 
 
537 aa  132  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201059  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.65 
 
 
724 aa  130  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  27.2 
 
 
472 aa  130  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4611  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 
743 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0416  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme12  24.5 
 
 
729 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5214  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.25 
 
 
774 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5065  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 
718 aa  127  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2958  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.36 
 
 
759 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4497  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.83 
 
 
734 aa  126  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.904654  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  22.09 
 
 
527 aa  125  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4129  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.67 
 
 
734 aa  125  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  21.9 
 
 
772 aa  121  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  24.39 
 
 
774 aa  120  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  23.8 
 
 
722 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0788  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 
749 aa  117  7.999999999999999e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1481  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.25 
 
 
467 aa  117  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.94 
 
 
722 aa  116  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  23.77 
 
 
797 aa  117  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>