201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5065 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5065  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 718 aa  1423    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  27.92 
 
 		 756 aa  169  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0674  lipopolysaccharide biosynthesis  29.43 
 
 		 764 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0975294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5390  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.28 
 
 		 491 aa  157  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.300037 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.38 
 
 		 745 aa  150  9e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.74 
 
 		 739 aa  147  6e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  29.49 
 
 		 750 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  26.32 
 
 		 738 aa  144  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.03 
 
 		 701 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  26.4 
 
 		 753 aa  142  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  25.07 
 
 		 772 aa  138  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4578  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.63 
 
 		 491 aa  137  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290602  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.36 
 
 		 748 aa  134  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4355  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27 
 
 		 696 aa  131  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  27.1 
 
 		 710 aa  130  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5050  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 707 aa  125  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.376238  normal  0.397595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4589  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 707 aa  125  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.260554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  24.1 
 
 		 756 aa  125  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4243  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.51 
 
 		 595 aa  125  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4500  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.77 
 
 		 537 aa  124  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4210  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.02 
 
 		 548 aa  124  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  24.03 
 
 		 790 aa  123  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  25.42 
 
 		 715 aa  121  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  24.49 
 
 		 782 aa  121  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4353  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.54 
 
 		 537 aa  117  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201059  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.41 
 
 		 759 aa  117  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  23.75 
 
 		 711 aa  115  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  25.35 
 
 		 713 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0387  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.12 
 
 		 509 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  22.5 
 
 		 756 aa  111  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0101  polysaccharide accessory transport protein, putative  27.44 
 
 		 572 aa  110  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  22.85 
 
 		 737 aa  110  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6014  exopolysaccharide polymerization/transport protein  26.9 
 
 		 737 aa  109  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807866  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0093  putative polysaccharide accessory transport protein  27.65 
 
 		 572 aa  109  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4605  polysaccharide biosynthesis transporter  25.17 
 
 		 763 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.599014 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0737  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 		 704 aa  107  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.875761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  25.54 
 
 		 734 aa  107  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0247  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.13 
 
 		 478 aa  107  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.484556 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2505  exopolysaccharide transport protein family  24.82 
 
 		 735 aa  107  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1008  lipopolysaccharide biosynthesis  25.89 
 
 		 687 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  22.67 
 
 		 758 aa  106  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  26.61 
 
 		 709 aa  106  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  23.78 
 
 		 743 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 		 750 aa  104  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2874  lipopolysaccharide biosynthesis  26.68 
 
 		 515 aa  103  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  24.64 
 
 		 773 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5214  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.84 
 
 		 774 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  23.87 
 
 		 872 aa  101  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1111  lipopolysaccharide biosynthesis  26.56 
 
 		 688 aa  101  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0416  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme12  24.23 
 
 		 729 aa  100  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1157  exopolysaccharide transport protein family  27.21 
 
 		 720 aa  99.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.238721  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 		 776 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.83 
 
 		 764 aa  99  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  24.38 
 
 		 742 aa  98.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  25.62 
 
 		 747 aa  98.2  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3091  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.53 
 
 		 784 aa  97.8  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00715976  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3369  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.37 
 
 		 731 aa  97.4  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  22.05 
 
 		 731 aa  97.1  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  26.2 
 
 		 776 aa  97.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2697  lipopolysaccharide biosynthesis  24.58 
 
 		 769 aa  96.3  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  24.26 
 
 		 788 aa  95.5  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0308  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.78 
 
 		 737 aa  94.7  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  22.88 
 
 		 755 aa  94.7  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  23.56 
 
 		 778 aa  93.6  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  21.28 
 
 		 758 aa  93.2  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  24.33 
 
 		 737 aa  90.5  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.07 
 
 		 785 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 		 726 aa  90.1  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.53 
 
 		 766 aa  89  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 		 724 aa  85.9  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.05 
 
 		 779 aa  85.1  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01392  exopolysaccharide xanthan biosynthesis chain length determinant protein GumC  26.37 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.402956  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1878  lipopolysaccharide biosynthesis  23.5 
 
 		 466 aa  84  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.950622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  24.62 
 
 		 726 aa  83.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2958  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.6 
 
 		 759 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0359  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme12  23.08 
 
 		 720 aa  83.2  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.302004  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  22.31 
 
 		 770 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1481  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.26 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  22.9 
 
 		 774 aa  82  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1537  GumC protein  26.35 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 		 751 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  20.87 
 
 		 756 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6092  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.29 
 
 		 730 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.666238  decreased coverage  0.00184203 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2528  lipopolysaccharide biosynthesis  23.9 
 
 		 510 aa  77.8  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.597062  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1794  chain length determinant protein  22.74 
 
 		 461 aa  77.4  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4611  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.97 
 
 		 743 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.45 
 
 		 643 aa  76.6  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  24.83 
 
 		 472 aa  77  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  25.27 
 
 		 475 aa  75.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2029  lipopolysaccharide biosynthesis  23.08 
 
 		 518 aa  75.1  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.911023  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  21.02 
 
 		 772 aa  74.7  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3070  lipopolysaccharide biosynthesis  24.31 
 
 		 500 aa  75.1  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  21.32 
 
 		 738 aa  73.6  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  20.36 
 
 		 708 aa  73.9  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.45 
 
 		 642 aa  73.9  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  20.71 
 
 		 789 aa  73.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0788  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.05 
 
 		 749 aa  72  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  19.93 
 
 		 753 aa  71.2  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  21.48 
 
 		 730 aa  70.1  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  24.62 
 
 		 733 aa  69.7  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>